117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2516 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  48.17 
 
 		 760 aa  646    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  48.22 
 
 		 759 aa  643    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  48.97 
 
 		 755 aa  653    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  49.31 
 
 		 751 aa  651    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  48.37 
 
 		 757 aa  659    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  47.36 
 
 		 770 aa  654    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  100 
 
 		 789 aa  1627    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  48.16 
 
 		 772 aa  635  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  48.73 
 
 		 771 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  48.58 
 
 		 772 aa  628  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  48.58 
 
 		 771 aa  628  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  47.24 
 
 		 739 aa  628  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  44.26 
 
 		 776 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  43.57 
 
 		 722 aa  570  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  36.48 
 
 		 791 aa  445  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  36.81 
 
 		 701 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.67 
 
 		 755 aa  440  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  35.51 
 
 		 794 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  36.81 
 
 		 763 aa  428  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  35.84 
 
 		 750 aa  422  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  34.81 
 
 		 740 aa  411  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  36.09 
 
 		 753 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  35.75 
 
 		 755 aa  399  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.29 
 
 		 712 aa  381  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.89 
 
 		 723 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  32.67 
 
 		 761 aa  368  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.04 
 
 		 732 aa  362  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  32.74 
 
 		 738 aa  361  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.98 
 
 		 725 aa  352  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.28 
 
 		 729 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.68 
 
 		 786 aa  338  2.9999999999999997e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  29.97 
 
 		 819 aa  292  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.68 
 
 		 1362 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  29.43 
 
 		 711 aa  275  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.33 
 
 		 812 aa  239  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.95 
 
 		 701 aa  236  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  27.27 
 
 		 774 aa  232  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.53 
 
 		 691 aa  226  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.21 
 
 		 671 aa  218  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.68 
 
 		 795 aa  218  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  26.18 
 
 		 831 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.75 
 
 		 1033 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  25.11 
 
 		 796 aa  196  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  24.53 
 
 		 776 aa  175  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  24.19 
 
 		 840 aa  132  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  22.82 
 
 		 833 aa  130  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  26.48 
 
 		 775 aa  112  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  20.9 
 
 		 713 aa  90.1  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.55 
 
 		 338 aa  87.8  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  31.36 
 
 		 1109 aa  81.6  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  20.81 
 
 		 680 aa  80.1  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  28.34 
 
 		 393 aa  69.7  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  28.4 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  24.87 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  26.83 
 
 		 420 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  27.84 
 
 		 589 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  26.57 
 
 		 415 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  29.33 
 
 		 624 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  26.09 
 
 		 462 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  26.22 
 
 		 571 aa  58.5  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1807  hypothetical protein  25.16 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  25.23 
 
 		 418 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  26.18 
 
 		 418 aa  56.2  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  29.76 
 
 		 625 aa  56.2  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  25.19 
 
 		 416 aa  55.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  28.65 
 
 		 418 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  28.65 
 
 		 418 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  32.81 
 
 		 523 aa  55.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  23.58 
 
 		 423 aa  55.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  29.24 
 
 		 425 aa  54.7  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  26.55 
 
 		 479 aa  54.3  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  26.99 
 
 		 459 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  25.47 
 
 		 421 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  27.63 
 
 		 426 aa  53.5  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  28 
 
 		 430 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  26.34 
 
 		 418 aa  53.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  25.53 
 
 		 792 aa  53.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  27.94 
 
 		 613 aa  52.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 		 698 aa  51.6  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  27.68 
 
 		 418 aa  52  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  29.47 
 
 		 642 aa  50.8  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  29.65 
 
 		 425 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  26.09 
 
 		 419 aa  50.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  27.98 
 
 		 717 aa  50.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3062  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  25.4 
 
 		 984 aa  50.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 640 aa  50.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  26.29 
 
 		 914 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  28.95 
 
 		 627 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  28.95 
 
 		 642 aa  48.5  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  29.38 
 
 		 575 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.38 
 
 		 575 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4001  hypothetical protein  24.65 
 
 		 959 aa  48.1  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000175491  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  28.95 
 
 		 642 aa  47.8  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  30.1 
 
 		 633 aa  47.8  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  27.72 
 
 		 562 aa  47.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  27.66 
 
 		 625 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  26.14 
 
 		 744 aa  47.8  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.215804 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2062  von Willebrand factor type A  22.98 
 
 		 356 aa  47  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.96 
 
 		 621 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  25.12 
 
 		 566 aa  47.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>