110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1400 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  55.98 
 
 		 755 aa  718    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  53.44 
 
 		 750 aa  648    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  100 
 
 		 732 aa  1434    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  64.95 
 
 		 729 aa  705    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  68.03 
 
 		 761 aa  818    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  82.68 
 
 		 723 aa  1070    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  96.48 
 
 		 738 aa  1233    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  69.71 
 
 		 725 aa  815    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  51 
 
 		 794 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  53.86 
 
 		 791 aa  618  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  50.53 
 
 		 755 aa  605  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  48.71 
 
 		 740 aa  531  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  39.59 
 
 		 712 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  35.52 
 
 		 757 aa  411  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  36.67 
 
 		 763 aa  409  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  36.25 
 
 		 739 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.99 
 
 		 751 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.56 
 
 		 772 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.92 
 
 		 770 aa  389  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  36.71 
 
 		 771 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.41 
 
 		 772 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.17 
 
 		 771 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.78 
 
 		 776 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  38.22 
 
 		 755 aa  379  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  33.04 
 
 		 789 aa  378  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.82 
 
 		 759 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  34.62 
 
 		 722 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  36.91 
 
 		 760 aa  368  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  35.74 
 
 		 701 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.66 
 
 		 786 aa  358  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.45 
 
 		 1362 aa  336  1e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  36.31 
 
 		 753 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  32.18 
 
 		 819 aa  300  5e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  34.57 
 
 		 831 aa  278  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  34.5 
 
 		 711 aa  271  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  32.42 
 
 		 691 aa  269  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  35.49 
 
 		 796 aa  259  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.15 
 
 		 812 aa  259  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  34.85 
 
 		 774 aa  259  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  34.07 
 
 		 795 aa  252  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.82 
 
 		 701 aa  239  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  34.23 
 
 		 1033 aa  233  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.68 
 
 		 671 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  27.93 
 
 		 776 aa  207  7e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  26.78 
 
 		 775 aa  159  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  26.78 
 
 		 713 aa  154  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  27.53 
 
 		 833 aa  128  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.57 
 
 		 680 aa  117  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  29.49 
 
 		 840 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  24.6 
 
 		 1109 aa  93.2  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  24.87 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  25.6 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  22.59 
 
 		 338 aa  72  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  25.6 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  31.74 
 
 		 828 aa  68.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  25.64 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  26.84 
 
 		 418 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  26.84 
 
 		 418 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  25.53 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  27.94 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  27.71 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  25.87 
 
 		 427 aa  63.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  25.82 
 
 		 412 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  31.21 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  29.29 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  29.8 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  27.1 
 
 		 423 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  36.13 
 
 		 942 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  24.72 
 
 		 363 aa  56.6  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  27.65 
 
 		 412 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  28.04 
 
 		 411 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  21.47 
 
 		 462 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  27.87 
 
 		 393 aa  55.8  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  25.25 
 
 		 571 aa  55.5  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  25.37 
 
 		 421 aa  55.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  27.66 
 
 		 847 aa  54.7  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  27.96 
 
 		 419 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  25.94 
 
 		 851 aa  52  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  24.79 
 
 		 418 aa  52  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  21.61 
 
 		 419 aa  51.6  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3164  hypothetical protein  29.69 
 
 		 1120 aa  50.8  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  25.33 
 
 		 416 aa  50.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  23.76 
 
 		 415 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  33.54 
 
 		 561 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  23.23 
 
 		 426 aa  49.7  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  28.71 
 
 		 546 aa  50.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2532  von Willebrand factor type A  30 
 
 		 464 aa  49.7  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177592  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  27.69 
 
 		 570 aa  48.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1604  von Willebrand factor type A  26.95 
 
 		 1100 aa  48.5  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3066  von Willebrand factor type A  28.49 
 
 		 425 aa  47.8  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000574906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4403  von Willebrand factor type A  33.78 
 
 		 450 aa  47.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3062  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  17.57 
 
 		 984 aa  47.8  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  28.64 
 
 		 918 aa  47.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  25.58 
 
 		 350 aa  46.2  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  26.47 
 
 		 888 aa  46.2  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  28.3 
 
 		 589 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  24.48 
 
 		 607 aa  46.2  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  27.64 
 
 		 629 aa  46.2  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>