128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2295 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  50.66 
 
 		 755 aa  643    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  52.08 
 
 		 750 aa  670    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  100 
 
 		 755 aa  1536    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  52.21 
 
 		 794 aa  667    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  55.37 
 
 		 791 aa  682    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  51.2 
 
 		 723 aa  620  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  51.3 
 
 		 761 aa  615  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  50.32 
 
 		 740 aa  614  9.999999999999999e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  52.01 
 
 		 732 aa  597  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  50.98 
 
 		 725 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  51.69 
 
 		 738 aa  590  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  48.4 
 
 		 729 aa  519  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  44.44 
 
 		 701 aa  498  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  36.94 
 
 		 789 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  40.44 
 
 		 776 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  36.66 
 
 		 763 aa  445  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  38.78 
 
 		 751 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  39.87 
 
 		 770 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  37.33 
 
 		 757 aa  433  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  38.11 
 
 		 739 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  39.94 
 
 		 772 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  38.7 
 
 		 755 aa  432  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  39.65 
 
 		 772 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  38.42 
 
 		 759 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.28 
 
 		 722 aa  429  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  39.65 
 
 		 771 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  39.32 
 
 		 771 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  38.02 
 
 		 760 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.26 
 
 		 712 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.22 
 
 		 786 aa  346  8.999999999999999e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  35.96 
 
 		 753 aa  345  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  35.93 
 
 		 1362 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  33.59 
 
 		 819 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.88 
 
 		 812 aa  273  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.69 
 
 		 701 aa  266  8e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  30.17 
 
 		 711 aa  266  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  32.23 
 
 		 671 aa  264  6e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  33.79 
 
 		 795 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.25 
 
 		 691 aa  263  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  32.37 
 
 		 831 aa  257  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  33.12 
 
 		 796 aa  250  7e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  33.11 
 
 		 774 aa  250  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  29.03 
 
 		 776 aa  236  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.52 
 
 		 1033 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  25.56 
 
 		 775 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  25.29 
 
 		 840 aa  152  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  26.1 
 
 		 833 aa  146  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  29.36 
 
 		 1109 aa  126  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.48 
 
 		 680 aa  125  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  23.63 
 
 		 713 aa  122  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  27.75 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  26.79 
 
 		 420 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  24.02 
 
 		 418 aa  73.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  27.96 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  26.09 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  26.4 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  23.04 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  23.36 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.36 
 
 		 338 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  26.51 
 
 		 416 aa  67  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  28.1 
 
 		 412 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  25.62 
 
 		 418 aa  66.6  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  27.37 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  27.38 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3164  hypothetical protein  28.09 
 
 		 1120 aa  64.3  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  23.65 
 
 		 426 aa  63.9  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  25.77 
 
 		 412 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  28.16 
 
 		 425 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  27.67 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  25.87 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  25.79 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  28.64 
 
 		 459 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  28.64 
 
 		 480 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  25.25 
 
 		 411 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.3 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  25.87 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  27.18 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3062  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  19.82 
 
 		 984 aa  58.5  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  28.31 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  27.42 
 
 		 423 aa  55.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  33.57 
 
 		 903 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  24.64 
 
 		 418 aa  55.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  29.84 
 
 		 842 aa  54.7  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  29.44 
 
 		 561 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4001  hypothetical protein  22.38 
 
 		 959 aa  53.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000175491  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  29.05 
 
 		 589 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  33.92 
 
 		 1077 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  33.91 
 
 		 523 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  23.45 
 
 		 462 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  27.32 
 
 		 847 aa  52  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  26.04 
 
 		 851 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3001  von Willebrand factor type A  28.82 
 
 		 365 aa  51.6  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  26.52 
 
 		 550 aa  52  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  26.92 
 
 		 421 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  22.86 
 
 		 479 aa  51.2  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  33.33 
 
 		 942 aa  51.6  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  27.03 
 
 		 808 aa  50.8  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2163  von Willebrand factor type A  28.1 
 
 		 440 aa  50.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.820546  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>