68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2129 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  100 
 
 
833 aa  1666    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  81.19 
 
 
840 aa  1331    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  24.55 
 
 
776 aa  174  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30 
 
 
712 aa  166  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.52 
 
 
759 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.28 
 
 
751 aa  162  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.98 
 
 
791 aa  158  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  24.27 
 
 
819 aa  157  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  27.3 
 
 
750 aa  156  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.99 
 
 
755 aa  156  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  25.76 
 
 
772 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.91 
 
 
772 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  26.81 
 
 
701 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.73 
 
 
794 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  29.65 
 
 
795 aa  148  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.16 
 
 
771 aa  149  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  24.76 
 
 
771 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  25.65 
 
 
757 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  25.89 
 
 
760 aa  144  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.09 
 
 
740 aa  143  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.08 
 
 
755 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  28.27 
 
 
755 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.16 
 
 
722 aa  139  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  31.58 
 
 
774 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  29.3 
 
 
761 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.64 
 
 
691 aa  134  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  26.77 
 
 
753 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.12 
 
 
701 aa  133  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  22.82 
 
 
789 aa  131  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  28.71 
 
 
796 aa  131  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  35.81 
 
 
338 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.49 
 
 
812 aa  127  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  25.86 
 
 
739 aa  127  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.28 
 
 
776 aa  125  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.74 
 
 
723 aa  125  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.99 
 
 
1033 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  27.26 
 
 
711 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  28.42 
 
 
831 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.53 
 
 
732 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.76 
 
 
738 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.88 
 
 
1362 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  22.19 
 
 
786 aa  112  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  24.71 
 
 
763 aa  100  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  24.45 
 
 
1109 aa  97.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.38 
 
 
725 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  23.18 
 
 
671 aa  91.7  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  21.84 
 
 
680 aa  89.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  27.01 
 
 
775 aa  89  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.51 
 
 
729 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1807  hypothetical protein  26.82 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.342612 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.16 
 
 
770 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  29.45 
 
 
713 aa  59.7  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  26.58 
 
 
459 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  32.56 
 
 
415 aa  55.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.31 
 
 
451 aa  53.5  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
419 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  29.14 
 
 
420 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  30.43 
 
 
412 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  27.17 
 
 
419 aa  51.2  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2062  von Willebrand factor type A  23.66 
 
 
356 aa  49.3  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  26.14 
 
 
421 aa  48.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  26.7 
 
 
418 aa  47.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  30.64 
 
 
412 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.45 
 
 
442 aa  46.6  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  22.44 
 
 
412 aa  46.2  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  28.5 
 
 
643 aa  45.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  25 
 
 
421 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4557  von Willebrand factor type A  48.98 
 
 
425 aa  44.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal  0.659076 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>