203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1843 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 420 aa  849    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  90.21 
 
 		 419 aa  778    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  70.67 
 
 		 419 aa  598  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  59.13 
 
 		 421 aa  493  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  46.56 
 
 		 415 aa  334  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  41.63 
 
 		 412 aa  315  8e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  41.38 
 
 		 412 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  41.61 
 
 		 418 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  33.25 
 
 		 425 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  34.06 
 
 		 423 aa  232  8.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  32.05 
 
 		 425 aa  226  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  31.22 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  31.88 
 
 		 412 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  30.03 
 
 		 412 aa  175  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0004  von Willebrand factor, type A  29.53 
 
 		 464 aa  170  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  28.8 
 
 		 418 aa  168  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  29.82 
 
 		 418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  31.28 
 
 		 427 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  30.59 
 
 		 441 aa  155  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  29.17 
 
 		 421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4213  von Willebrand factor type A  27.65 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  30.41 
 
 		 426 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  29.52 
 
 		 418 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  32.08 
 
 		 418 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  28.38 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  26.29 
 
 		 416 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.68 
 
 		 460 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  29.68 
 
 		 472 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.35 
 
 		 472 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.05 
 
 		 451 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  28.65 
 
 		 411 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.58 
 
 		 442 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  31.07 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  26.68 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  26.16 
 
 		 615 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  29.18 
 
 		 419 aa  97.4  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  28.81 
 
 		 412 aa  96.3  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  32.44 
 
 		 452 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  26.63 
 
 		 446 aa  93.2  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  31.58 
 
 		 452 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  26.79 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4557  von Willebrand factor type A  26.45 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal  0.659076 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  26.01 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  27.83 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  28.25 
 
 		 505 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.93 
 
 		 776 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4403  von Willebrand factor type A  29.92 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5589  hypothetical protein  34.15 
 
 		 143 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  28.92 
 
 		 490 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  29.95 
 
 		 761 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4946  von Willebrand factor type A  29.13 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0264631  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2163  von Willebrand factor type A  26.91 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.820546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.6 
 
 		 732 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  23.66 
 
 		 571 aa  72.8  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.92 
 
 		 755 aa  72.8  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  32.02 
 
 		 480 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.98 
 
 		 738 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  27.27 
 
 		 776 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  24.44 
 
 		 902 aa  71.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  26.11 
 
 		 479 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2062  von Willebrand factor type A  24.69 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3147  von Willebrand factor, type A  23.86 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.03337 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.23 
 
 		 1362 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  26.57 
 
 		 610 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  28.4 
 
 		 563 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.84 
 
 		 740 aa  68.2  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.12 
 
 		 791 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  26.12 
 
 		 888 aa  67.4  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  31.74 
 
 		 842 aa  67.4  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.56 
 
 		 771 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  31.21 
 
 		 847 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  28.43 
 
 		 562 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  28.47 
 
 		 566 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  29.94 
 
 		 792 aa  66.2  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.27 
 
 		 755 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  28.57 
 
 		 755 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.89 
 
 		 772 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26 
 
 		 725 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  25.33 
 
 		 771 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  27.71 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.14 
 
 		 723 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  26.83 
 
 		 789 aa  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.82 
 
 		 759 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.36 
 
 		 751 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  23.73 
 
 		 770 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  26.48 
 
 		 760 aa  63.2  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.32 
 
 		 794 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  30.06 
 
 		 851 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  27.37 
 
 		 903 aa  63.2  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  28.95 
 
 		 775 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  24.34 
 
 		 701 aa  62.4  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  28.8 
 
 		 706 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  28.02 
 
 		 750 aa  62.4  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2461  von Willebrand factor type A  27.67 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0207463  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0183  von Willebrand factor type A  26.11 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  25.67 
 
 		 593 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  29.19 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0048  von Willebrand factor type A  28.03 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  30.12 
 
 		 561 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  26.45 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>