107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0140 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  63.44 
 
 		 701 aa  838    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  100 
 
 		 711 aa  1423    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  62.65 
 
 		 691 aa  802    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  51.54 
 
 		 812 aa  631  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  46.93 
 
 		 671 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  38.23 
 
 		 1362 aa  348  3e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 819 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.95 
 
 		 751 aa  295  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.9 
 
 		 772 aa  293  7e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.33 
 
 		 755 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.1 
 
 		 772 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  32.42 
 
 		 771 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.23 
 
 		 759 aa  283  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.1 
 
 		 771 aa  282  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  33.44 
 
 		 750 aa  276  7e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  31.86 
 
 		 757 aa  272  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  29.54 
 
 		 789 aa  271  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  30.78 
 
 		 760 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.52 
 
 		 723 aa  267  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  33.22 
 
 		 761 aa  266  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.91 
 
 		 794 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.42 
 
 		 755 aa  265  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.6 
 
 		 791 aa  263  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  31.86 
 
 		 755 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.06 
 
 		 740 aa  256  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  29.05 
 
 		 739 aa  254  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.77 
 
 		 732 aa  253  7e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  34.97 
 
 		 738 aa  251  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.58 
 
 		 712 aa  249  9e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  33.17 
 
 		 774 aa  249  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  29.28 
 
 		 763 aa  243  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29 
 
 		 776 aa  241  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.16 
 
 		 722 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.95 
 
 		 725 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  32.58 
 
 		 796 aa  230  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.9 
 
 		 795 aa  229  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.42 
 
 		 770 aa  228  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  27.59 
 
 		 776 aa  219  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.89 
 
 		 729 aa  217  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  27.89 
 
 		 753 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  27.48 
 
 		 701 aa  213  7e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  30.42 
 
 		 831 aa  213  9e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.46 
 
 		 1033 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.54 
 
 		 786 aa  187  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.74 
 
 		 680 aa  153  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  25.16 
 
 		 713 aa  135  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  25.17 
 
 		 775 aa  130  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  27.26 
 
 		 833 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  26.49 
 
 		 1109 aa  112  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  28.81 
 
 		 840 aa  110  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.85 
 
 		 338 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  29.34 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  24.62 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  27.23 
 
 		 563 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  29.7 
 
 		 571 aa  60.1  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  24.35 
 
 		 426 aa  60.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  27.03 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  30.16 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  27.78 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  28.65 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  29.73 
 
 		 419 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  24.37 
 
 		 566 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  31.45 
 
 		 744 aa  55.1  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  27.23 
 
 		 412 aa  54.7  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  25.45 
 
 		 412 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 		 418 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  23.6 
 
 		 935 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 		 418 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  26.83 
 
 		 423 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  28.18 
 
 		 480 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  29.09 
 
 		 419 aa  52.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  29.8 
 
 		 411 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  28.19 
 
 		 1188 aa  52.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  28.49 
 
 		 490 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  26.87 
 
 		 903 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  26.78 
 
 		 625 aa  51.2  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  28.48 
 
 		 543 aa  50.8  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  29.71 
 
 		 561 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  27.36 
 
 		 421 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  27.07 
 
 		 425 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  24.64 
 
 		 698 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  26.09 
 
 		 421 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  29.5 
 
 		 592 aa  48.9  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  26.19 
 
 		 412 aa  48.9  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  24.16 
 
 		 380 aa  48.5  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  31.54 
 
 		 1077 aa  48.5  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  23.7 
 
 		 418 aa  48.1  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  28.65 
 
 		 792 aa  48.1  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  29.41 
 
 		 942 aa  48.1  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  23.76 
 
 		 536 aa  47.4  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  32.43 
 
 		 523 aa  47.4  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  26.11 
 
 		 363 aa  47  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  25.27 
 
 		 418 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  25.97 
 
 		 425 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  27.1 
 
 		 551 aa  46.6  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  27.62 
 
 		 350 aa  46.6  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  24.2 
 
 		 643 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2062  von Willebrand factor type A  24.06 
 
 		 356 aa  45.4  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  24.86 
 
 		 418 aa  45.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  26.5 
 
 		 430 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>