192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1463 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
425 aa  857    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  91.06 
 
 
425 aa  790    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  58.54 
 
 
418 aa  499  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  53.79 
 
 
423 aa  455  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  33.25 
 
 
420 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  33.25 
 
 
412 aa  226  8e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  31.88 
 
 
419 aa  223  7e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  32.61 
 
 
415 aa  219  8.999999999999998e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  33.74 
 
 
419 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  33.58 
 
 
421 aa  213  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
418 aa  210  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  32.45 
 
 
412 aa  206  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  29.87 
 
 
412 aa  169  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  30.28 
 
 
418 aa  163  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  29.84 
 
 
418 aa  160  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  31.71 
 
 
412 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  30.1 
 
 
418 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  31.56 
 
 
421 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  29.84 
 
 
418 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  29.23 
 
 
426 aa  155  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  28.89 
 
 
427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  36.71 
 
 
462 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.65 
 
 
442 aa  121  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  33.19 
 
 
416 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.92 
 
 
460 aa  116  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  30.92 
 
 
472 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4213  von Willebrand factor type A  24.45 
 
 
455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.43 
 
 
472 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.81 
 
 
451 aa  113  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  31.27 
 
 
615 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  31.98 
 
 
419 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  34.18 
 
 
563 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  30.81 
 
 
411 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  34.53 
 
 
412 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  33.66 
 
 
566 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  31.34 
 
 
612 aa  95.1  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  27.83 
 
 
633 aa  93.6  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  26.43 
 
 
452 aa  93.2  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  32.02 
 
 
642 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  35.03 
 
 
490 aa  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  32.02 
 
 
627 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  25.06 
 
 
441 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  33.67 
 
 
613 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  31.58 
 
 
505 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  28.64 
 
 
571 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  30.69 
 
 
536 aa  88.2  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  31.47 
 
 
642 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  24.07 
 
 
467 aa  87.4  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  31.53 
 
 
642 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  31.63 
 
 
625 aa  86.7  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  31.12 
 
 
624 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  27.19 
 
 
592 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  25.67 
 
 
452 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0004  von Willebrand factor, type A  24.15 
 
 
464 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  26.87 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  27.84 
 
 
575 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.63 
 
 
621 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  29.9 
 
 
430 aa  84.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.84 
 
 
575 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  30.96 
 
 
706 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  30 
 
 
639 aa  83.2  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  29.38 
 
 
625 aa  83.2  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  29.53 
 
 
640 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  30.96 
 
 
698 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.84 
 
 
588 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  32.55 
 
 
423 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  27.55 
 
 
598 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  28.64 
 
 
446 aa  80.9  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  27.04 
 
 
593 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  29.68 
 
 
610 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  27.2 
 
 
459 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  27.04 
 
 
651 aa  73.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  27.14 
 
 
792 aa  73.2  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5589  hypothetical protein  42.39 
 
 
143 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  34.59 
 
 
1362 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  24.23 
 
 
629 aa  72  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  30.49 
 
 
761 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.14 
 
 
725 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  25.63 
 
 
480 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  26.18 
 
 
651 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  27.65 
 
 
555 aa  70.5  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  27.04 
 
 
551 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  27.27 
 
 
643 aa  70.1  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  28.96 
 
 
708 aa  69.7  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  27.89 
 
 
350 aa  69.7  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.1 
 
 
759 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.48 
 
 
755 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  25.37 
 
 
479 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  28.31 
 
 
654 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.14 
 
 
772 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  28.5 
 
 
842 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  32.14 
 
 
771 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  27.56 
 
 
828 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.48 
 
 
751 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.14 
 
 
772 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  28.04 
 
 
753 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  23.94 
 
 
686 aa  67  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  28.43 
 
 
709 aa  67  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  27.91 
 
 
588 aa  66.2  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.14 
 
 
771 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>