174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3379 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  100 
 
 		 786 aa  1608    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  37.62 
 
 		 763 aa  408  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.11 
 
 		 722 aa  363  9e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  32.71 
 
 		 750 aa  363  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.62 
 
 		 755 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.63 
 
 		 723 aa  356  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  32.95 
 
 		 757 aa  353  7e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.58 
 
 		 751 aa  352  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.43 
 
 		 759 aa  351  3e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  34.22 
 
 		 755 aa  350  5e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  34.5 
 
 		 738 aa  349  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  31.69 
 
 		 789 aa  349  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.94 
 
 		 770 aa  348  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.94 
 
 		 732 aa  347  6e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  34.27 
 
 		 791 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  31.9 
 
 		 760 aa  340  8e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  31.93 
 
 		 761 aa  340  9e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  33.59 
 
 		 701 aa  335  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  33.28 
 
 		 794 aa  332  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.66 
 
 		 740 aa  331  3e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.78 
 
 		 712 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  31.84 
 
 		 755 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  32.71 
 
 		 739 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.05 
 
 		 772 aa  324  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.1 
 
 		 772 aa  323  6e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.09 
 
 		 776 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  31.49 
 
 		 771 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.22 
 
 		 771 aa  320  9e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.49 
 
 		 725 aa  301  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.88 
 
 		 729 aa  283  9e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.67 
 
 		 1362 aa  260  9e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  28.01 
 
 		 819 aa  253  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  25.48 
 
 		 795 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  36.76 
 
 		 753 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  23.82 
 
 		 774 aa  211  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  24.67 
 
 		 796 aa  211  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  24.48 
 
 		 831 aa  203  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.93 
 
 		 671 aa  192  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.85 
 
 		 1033 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.59 
 
 		 812 aa  192  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  24.54 
 
 		 711 aa  192  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.41 
 
 		 691 aa  191  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.53 
 
 		 701 aa  186  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  24.23 
 
 		 776 aa  177  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  22.15 
 
 		 775 aa  162  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  22.19 
 
 		 833 aa  119  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  23.44 
 
 		 840 aa  117  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  23.82 
 
 		 713 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  25.59 
 
 		 1109 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  20.06 
 
 		 680 aa  88.6  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  23.86 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  26.99 
 
 		 842 aa  72.8  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  23.35 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  27.45 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  29.03 
 
 		 571 aa  63.9  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  31.97 
 
 		 888 aa  62.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  23.43 
 
 		 523 aa  62.4  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  21.48 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  22.51 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  26.83 
 
 		 562 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  28.34 
 
 		 828 aa  62.4  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  22.77 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  26.06 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  26.06 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.84 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.44 
 
 		 451 aa  60.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  25.9 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  23.81 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.81 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  26.03 
 
 		 792 aa  58.9  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  22.27 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  27.08 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  23.98 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  27.04 
 
 		 550 aa  58.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  26.23 
 
 		 563 aa  57  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0183  von Willebrand factor type A  27.75 
 
 		 432 aa  57.4  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 744 aa  57  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  27.44 
 
 		 561 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 		 500 aa  56.2  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  24.75 
 
 		 459 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16980  uncharacterized conserved protein (DUF2135)  24.81 
 
 		 1115 aa  55.5  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  25.39 
 
 		 412 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  26.11 
 
 		 426 aa  55.1  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  25.85 
 
 		 575 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  27.74 
 
 		 605 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  24.71 
 
 		 902 aa  53.9  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.85 
 
 		 575 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  23.35 
 
 		 421 aa  53.9  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0295  vault protein inter-alpha-trypsin  22.26 
 
 		 995 aa  53.5  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00370516  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  27.53 
 
 		 570 aa  53.5  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  25.13 
 
 		 412 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  24.37 
 
 		 423 aa  53.5  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  21.69 
 
 		 479 aa  53.5  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  25.67 
 
 		 350 aa  53.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  24.88 
 
 		 624 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  22.88 
 
 		 412 aa  52.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  18.75 
 
 		 602 aa  52.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  29.44 
 
 		 610 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.23 
 
 		 588 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  22.67 
 
 		 418 aa  52  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>