71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0183 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0183  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 432 aa  868    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4403  von Willebrand factor type A  61.86 
 
 		 450 aa  481  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2163  von Willebrand factor type A  50.11 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.820546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3066  von Willebrand factor type A  48.84 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000574906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0368  von Willebrand factor type A  49.2 
 
 		 428 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00177271  decreased coverage  0.000715031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4946  von Willebrand factor type A  48.4 
 
 		 431 aa  355  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0264631  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4557  von Willebrand factor type A  45.81 
 
 		 425 aa  343  4e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal  0.659076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2461  von Willebrand factor type A  45.5 
 
 		 432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0207463  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2532  von Willebrand factor type A  42.76 
 
 		 464 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0400  von Willebrand factor type A  38.89 
 
 		 476 aa  226  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1137  serine/threonine protein kinase  37.98 
 
 		 962 aa  216  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4249  hypothetical protein  51.33 
 
 		 145 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.832481  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  30.14 
 
 		 418 aa  76.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  32.06 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  31.46 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  25.54 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  25.08 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  29.17 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  23.96 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  29.17 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  26.21 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  25.37 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  27.11 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  25.29 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  26.11 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  26.94 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  25.79 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  26.48 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  26.72 
 
 		 418 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  25 
 
 		 425 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  29.3 
 
 		 412 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  25.35 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.9 
 
 		 712 aa  53.9  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  27.81 
 
 		 717 aa  53.5  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  28.41 
 
 		 1188 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.75 
 
 		 786 aa  50.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  35.2 
 
 		 592 aa  50.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  29.03 
 
 		 851 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  26.61 
 
 		 412 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  25.62 
 
 		 888 aa  50.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  29.89 
 
 		 847 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  35.71 
 
 		 625 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.1 
 
 		 755 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  33.04 
 
 		 575 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  34.21 
 
 		 774 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 		 903 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.04 
 
 		 575 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.04 
 
 		 588 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.57 
 
 		 755 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.63 
 
 		 751 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.37 
 
 		 723 aa  47  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  25.81 
 
 		 412 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.91 
 
 		 738 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.8 
 
 		 759 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  28.57 
 
 		 582 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  34.82 
 
 		 651 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  34.82 
 
 		 651 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.04 
 
 		 621 aa  44.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.26 
 
 		 772 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.79 
 
 		 442 aa  44.3  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  29.11 
 
 		 562 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  29.51 
 
 		 842 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  26.71 
 
 		 892 aa  43.9  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  29.52 
 
 		 618 aa  43.9  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  32.2 
 
 		 563 aa  43.5  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  34.62 
 
 		 828 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.26 
 
 		 772 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  31.25 
 
 		 640 aa  43.5  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.46 
 
 		 732 aa  43.5  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  30.51 
 
 		 412 aa  43.1  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  28.82 
 
 		 771 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>