161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54892 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  100 
 
 
523 aa  1084    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  26.65 
 
 
462 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  26.08 
 
 
416 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  26.3 
 
 
423 aa  97.4  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  25.4 
 
 
480 aa  90.5  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  27.95 
 
 
412 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.14 
 
 
451 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  23.3 
 
 
430 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  22.77 
 
 
411 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.32 
 
 
442 aa  81.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  24.93 
 
 
421 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  27.82 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 
421 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  23.43 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 
418 aa  77.4  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 
418 aa  75.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  34.88 
 
 
571 aa  75.1  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  24.87 
 
 
418 aa  74.3  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  23.15 
 
 
459 aa  73.9  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 
505 aa  73.6  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  26.71 
 
 
426 aa  73.6  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  25.58 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  26.62 
 
 
563 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  34.96 
 
 
753 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  24.54 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  21.81 
 
 
460 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  25.48 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  21.4 
 
 
472 aa  67.4  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  21.4 
 
 
472 aa  67.4  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  34.4 
 
 
546 aa  67  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  26.87 
 
 
479 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  25.34 
 
 
427 aa  64.7  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  35.29 
 
 
543 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  38.21 
 
 
1077 aa  64.3  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.54 
 
 
725 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  24.91 
 
 
610 aa  63.9  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
561 aa  63.5  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  32.58 
 
 
562 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  24.14 
 
 
350 aa  62.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  26.59 
 
 
566 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  32.28 
 
 
792 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.093276 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  30.4 
 
 
575 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  37.19 
 
 
760 aa  62  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  35.94 
 
 
757 aa  61.6  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.4 
 
 
575 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  23.62 
 
 
500 aa  61.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.4 
 
 
588 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  23.17 
 
 
412 aa  60.8  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.09 
 
 
751 aa  60.5  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.09 
 
 
755 aa  60.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  36.52 
 
 
755 aa  60.5  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  34.43 
 
 
592 aa  60.1  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  31.53 
 
 
418 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.81 
 
 
759 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3131  von Willebrand factor, type A  29.08 
 
 
565 aa  59.3  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  24.71 
 
 
412 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  27.52 
 
 
842 aa  58.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  25.21 
 
 
420 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  32.54 
 
 
761 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
425 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  21.28 
 
 
423 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  22.44 
 
 
615 aa  57.4  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5589  hypothetical protein  31.34 
 
 
143 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.95 
 
 
740 aa  57  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.83 
 
 
776 aa  57  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  32.74 
 
 
717 aa  57  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  26.15 
 
 
490 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  35.96 
 
 
712 aa  56.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  33.86 
 
 
739 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.43 
 
 
786 aa  55.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  27.88 
 
 
624 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  35.96 
 
 
750 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  32.81 
 
 
789 aa  55.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  22.98 
 
 
418 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  36.96 
 
 
536 aa  55.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.31 
 
 
772 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  33.83 
 
 
942 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  31.71 
 
 
425 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  31.25 
 
 
550 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  33.9 
 
 
774 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  22.76 
 
 
419 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  29.41 
 
 
547 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.61 
 
 
771 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  32.77 
 
 
771 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  31.25 
 
 
651 aa  53.5  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.21 
 
 
795 aa  53.9  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  31.25 
 
 
651 aa  53.5  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.82 
 
 
772 aa  53.5  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  27.4 
 
 
625 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.17 
 
 
770 aa  53.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  31.01 
 
 
654 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 
618 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  29.01 
 
 
573 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  30.58 
 
 
763 aa  52.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.91 
 
 
755 aa  52.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  30.86 
 
 
582 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  32.17 
 
 
819 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  26.47 
 
 
415 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1604  von Willebrand factor type A  26.84 
 
 
1100 aa  52  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>