111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1793 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  100 
 
 		 776 aa  1588    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  49.47 
 
 		 739 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  45.86 
 
 		 757 aa  581  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  44.26 
 
 		 770 aa  582  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  44.03 
 
 		 789 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  44.46 
 
 		 772 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  44.72 
 
 		 772 aa  572  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  44.78 
 
 		 760 aa  566  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  45.79 
 
 		 755 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  45.02 
 
 		 751 aa  560  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  47.14 
 
 		 771 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  44.31 
 
 		 771 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  46.51 
 
 		 759 aa  557  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  45.77 
 
 		 722 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  40.85 
 
 		 755 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  40.77 
 
 		 753 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.46 
 
 		 740 aa  397  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  36.1 
 
 		 701 aa  389  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  34.42 
 
 		 712 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  36.09 
 
 		 761 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  36.26 
 
 		 750 aa  378  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  37.26 
 
 		 791 aa  379  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  36.65 
 
 		 794 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  36.6 
 
 		 755 aa  372  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.32 
 
 		 723 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.78 
 
 		 732 aa  366  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  36.57 
 
 		 738 aa  361  3e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.01 
 
 		 725 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  35.15 
 
 		 729 aa  327  6e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.28 
 
 		 786 aa  315  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.47 
 
 		 1362 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  33.65 
 
 		 763 aa  251  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  28.45 
 
 		 711 aa  249  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.4 
 
 		 701 aa  242  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  28.03 
 
 		 819 aa  235  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.83 
 
 		 691 aa  232  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.22 
 
 		 812 aa  225  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.53 
 
 		 671 aa  217  7e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  28.64 
 
 		 774 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.17 
 
 		 1033 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  26.95 
 
 		 796 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  25.91 
 
 		 776 aa  182  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  25.6 
 
 		 795 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  25.48 
 
 		 831 aa  176  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  25.28 
 
 		 833 aa  125  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  22.84 
 
 		 680 aa  110  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  21.66 
 
 		 713 aa  106  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  28.29 
 
 		 775 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.27 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  24.15 
 
 		 1109 aa  82  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  25.93 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  26.52 
 
 		 419 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  26.38 
 
 		 840 aa  75.9  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  30.56 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  27 
 
 		 418 aa  72  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  29.22 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  25.37 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  29.53 
 
 		 416 aa  66.6  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  28.79 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  28.02 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  25.84 
 
 		 412 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 		 418 aa  63.5  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  27.14 
 
 		 423 aa  63.9  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  27.05 
 
 		 412 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  24.37 
 
 		 415 aa  62  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  23.73 
 
 		 462 aa  62.4  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  29.94 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  25.84 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  29.59 
 
 		 480 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  25.76 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  24.75 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.64 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  24.05 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  25.25 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.08 
 
 		 460 aa  57.8  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  22.22 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.51 
 
 		 451 aa  57  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  33.83 
 
 		 523 aa  57  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  27.18 
 
 		 411 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  27.89 
 
 		 610 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  22.89 
 
 		 472 aa  56.6  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  25.85 
 
 		 418 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  25.85 
 
 		 418 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  26.92 
 
 		 479 aa  55.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  26.46 
 
 		 412 aa  55.1  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  27.51 
 
 		 842 aa  54.7  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  22.49 
 
 		 472 aa  54.3  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  29.17 
 
 		 550 aa  53.9  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 		 589 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  25.2 
 
 		 851 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  28.88 
 
 		 828 aa  52.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  27.14 
 
 		 426 aa  52.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  27.59 
 
 		 847 aa  52  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  27.37 
 
 		 571 aa  52  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  31.9 
 
 		 744 aa  51.2  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1807  hypothetical protein  30.15 
 
 		 382 aa  50.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342612 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3001  von Willebrand factor type A  28.8 
 
 		 365 aa  50.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  28.47 
 
 		 570 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.74 
 
 		 588 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  26.74 
 
 		 575 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>