99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3108 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  100 
 
 		 713 aa  1468    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  39.17 
 
 		 680 aa  483  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.79 
 
 		 791 aa  160  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.53 
 
 		 794 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.35 
 
 		 812 aa  150  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.43 
 
 		 701 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.2 
 
 		 723 aa  139  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.48 
 
 		 732 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.56 
 
 		 738 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  25 
 
 		 711 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  23.73 
 
 		 775 aa  135  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  25.08 
 
 		 691 aa  132  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  24.07 
 
 		 755 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  24.45 
 
 		 750 aa  129  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  24.48 
 
 		 819 aa  123  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  23.56 
 
 		 761 aa  122  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  23.63 
 
 		 755 aa  121  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  23.41 
 
 		 671 aa  122  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  24.84 
 
 		 795 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  22.08 
 
 		 759 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  22.12 
 
 		 755 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  21.94 
 
 		 772 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.92 
 
 		 712 aa  114  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.82 
 
 		 786 aa  111  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  21.85 
 
 		 760 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  21.33 
 
 		 751 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  22.15 
 
 		 772 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  22.94 
 
 		 701 aa  110  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  23.58 
 
 		 725 aa  109  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  21.69 
 
 		 776 aa  106  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  22.24 
 
 		 739 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.93 
 
 		 1362 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  21.66 
 
 		 770 aa  105  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  25.47 
 
 		 763 aa  102  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  20.58 
 
 		 757 aa  101  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  22.29 
 
 		 740 aa  95.9  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.31 
 
 		 771 aa  90.9  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  20.93 
 
 		 789 aa  90.1  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  24.38 
 
 		 771 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.43 
 
 		 729 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  20.35 
 
 		 776 aa  82.8  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  21.79 
 
 		 753 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  24.32 
 
 		 774 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  26.46 
 
 		 831 aa  77.8  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.44 
 
 		 722 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  24.12 
 
 		 1109 aa  73.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  24.25 
 
 		 796 aa  68.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3164  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1120 aa  61.2  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.03 
 
 		 1033 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  32.39 
 
 		 479 aa  60.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  23.68 
 
 		 412 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  29.45 
 
 		 833 aa  59.7  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  31.48 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  28 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1819  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  29.33 
 
 		 963 aa  58.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.541917  normal  0.345133 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  26.02 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  29.24 
 
 		 416 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3062  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.39 
 
 		 984 aa  56.6  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  25.61 
 
 		 418 aa  55.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16980  uncharacterized conserved protein (DUF2135)  27.41 
 
 		 1115 aa  55.1  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0295  vault protein inter-alpha-trypsin  27.69 
 
 		 995 aa  54.7  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00370516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  27.31 
 
 		 462 aa  54.7  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  25.5 
 
 		 412 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  29.49 
 
 		 3027 aa  52.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.81 
 
 		 442 aa  53.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0459  von Willebrand factor type A  31.14 
 
 		 320 aa  52.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.24 
 
 		 451 aa  52.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  27.61 
 
 		 840 aa  51.6  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 426 aa  51.2  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4001  hypothetical protein  26.56 
 
 		 959 aa  50.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000175491  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  26.86 
 
 		 546 aa  50.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  27.7 
 
 		 325 aa  49.3  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  25.58 
 
 		 2588 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  27.38 
 
 		 828 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  26.56 
 
 		 423 aa  48.1  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  30.47 
 
 		 642 aa  48.1  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  26.21 
 
 		 418 aa  47.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  27.35 
 
 		 419 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  27.66 
 
 		 610 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  29.69 
 
 		 627 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  26.9 
 
 		 686 aa  45.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  24.62 
 
 		 419 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2860  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1066 aa  45.8  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.27882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  26.02 
 
 		 459 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  29.69 
 
 		 500 aa  45.8  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  30.47 
 
 		 642 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  30.63 
 
 		 613 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0051  von Willebrand factor type A  26.87 
 
 		 325 aa  45.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0945  von Willebrand factor type A  28.36 
 
 		 2166 aa  45.4  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.775742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  25.81 
 
 		 336 aa  45.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  24.76 
 
 		 307 aa  45.1  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  31.25 
 
 		 625 aa  45.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  24.04 
 
 		 629 aa  45.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0547  von Willebrand factor, type A  29.75 
 
 		 656 aa  44.3  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.58181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  24.86 
 
 		 363 aa  44.3  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  29.69 
 
 		 642 aa  44.3  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  29.94 
 
 		 559 aa  44.3  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  27.65 
 
 		 851 aa  43.9  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>