35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2860 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2860  hypothetical protein  100 
 
 		 1066 aa  2182    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.27882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2477  hypothetical protein  25.59 
 
 		 992 aa  250  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184778  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3062  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  24.44 
 
 		 984 aa  219  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0295  vault protein inter-alpha-trypsin  23.04 
 
 		 995 aa  216  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00370516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4001  hypothetical protein  22.9 
 
 		 959 aa  197  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000175491  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1819  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  24.48 
 
 		 963 aa  171  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.541917  normal  0.345133 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16980  uncharacterized conserved protein (DUF2135)  30.96 
 
 		 1115 aa  137  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2571  hypothetical protein  36.28 
 
 		 270 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  3.51589e-17  normal  0.0950053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6588  hypothetical protein  36.28 
 
 		 271 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683037  normal  0.0152413 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1433  conserved hypothetical protein  37.74 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02111  hypothetical protein  37.74 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.529062  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1425  hypothetical protein  37.74 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02152  hypothetical protein  37.74 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.5101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2366  hypothetical protein  37.74 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3359  hypothetical protein  37.74 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.783819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2521  hypothetical protein  37.74 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000025623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4998  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3307  putative signal peptide protein  36.28 
 
 		 280 aa  67  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0281892 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3027  signal peptide protein  35.14 
 
 		 282 aa  66.6  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0193368  normal  0.0163712 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2960  signal peptide protein  35.4 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0142734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5101  hypothetical protein  32.5 
 
 		 263 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58230  hypothetical protein  31.67 
 
 		 263 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2374  hypothetical protein  37.74 
 
 		 258 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5003  hypothetical protein  35.53 
 
 		 263 aa  56.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58290  hypothetical protein  30.38 
 
 		 269 aa  55.1  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5106  hypothetical protein  29.11 
 
 		 269 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.47 
 
 		 680 aa  50.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3308  putative signal peptide protein  30.67 
 
 		 267 aa  48.5  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.027267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2961  putative signal peptide protein  30.67 
 
 		 267 aa  48.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147846 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3028  putative signal peptide protein  30.67 
 
 		 267 aa  48.1  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0370173  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3152  hypothetical protein  31.45 
 
 		 446 aa  48.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3164  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1120 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2506  hypothetical protein  22.52 
 
 		 461 aa  48.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.280474  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  23.85 
 
 		 713 aa  46.2  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  26.98 
 
 		 796 aa  45.8  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>