38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2477 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2477  hypothetical protein  100 
 
 		 992 aa  2013    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184778  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0295  vault protein inter-alpha-trypsin  34.63 
 
 		 995 aa  584  1.0000000000000001e-165  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00370516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3062  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.5 
 
 		 984 aa  493  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4001  hypothetical protein  28.36 
 
 		 959 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000175491  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1819  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  56.43 
 
 		 963 aa  361  3e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.541917  normal  0.345133 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16980  uncharacterized conserved protein (DUF2135)  28.78 
 
 		 1115 aa  320  9e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2860  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1066 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.27882  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1433  conserved hypothetical protein  36.75 
 
 		 258 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02111  hypothetical protein  36.75 
 
 		 258 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.529062  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3359  hypothetical protein  36.75 
 
 		 258 aa  83.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.783819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1425  hypothetical protein  36.75 
 
 		 258 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2521  hypothetical protein  36.75 
 
 		 258 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000025623  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2366  hypothetical protein  36.75 
 
 		 258 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02152  hypothetical protein  36.75 
 
 		 258 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.5101  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3027  signal peptide protein  35.83 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0193368  normal  0.0163712 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3307  putative signal peptide protein  36.52 
 
 		 280 aa  74.3  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0281892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2960  signal peptide protein  36.52 
 
 		 280 aa  73.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0142734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5101  hypothetical protein  31.25 
 
 		 263 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58230  hypothetical protein  30.47 
 
 		 263 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2571  hypothetical protein  33.62 
 
 		 270 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  3.51589e-17  normal  0.0950053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6588  hypothetical protein  33.62 
 
 		 271 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683037  normal  0.0152413 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3164  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1120 aa  67.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4998  hypothetical protein  27.56 
 
 		 270 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2374  hypothetical protein  35.9 
 
 		 258 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58290  hypothetical protein  25.32 
 
 		 269 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5003  hypothetical protein  23.9 
 
 		 263 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5106  hypothetical protein  24.68 
 
 		 269 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  29.55 
 
 		 775 aa  51.6  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3152  hypothetical protein  31.82 
 
 		 446 aa  51.2  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  37.5 
 
 		 899 aa  48.9  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0152  hypothetical protein  34.15 
 
 		 586 aa  48.1  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.621521  hitchhiker  0.000148726 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3308  putative signal peptide protein  30.99 
 
 		 267 aa  48.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.027267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2961  putative signal peptide protein  30.99 
 
 		 267 aa  48.1  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147846 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3028  putative signal peptide protein  29.58 
 
 		 267 aa  47.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0370173  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1877  hypothetical protein  31.58 
 
 		 377 aa  45.4  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0988168  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3829  hypothetical protein  31.58 
 
 		 336 aa  45.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0944  hypothetical protein  31.58 
 
 		 377 aa  45.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00926262  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 280 aa  44.7  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>