41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6588 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6588  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683037  normal  0.0152413 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2571  hypothetical protein  94.46 
 
 		 270 aa  521  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  3.51589e-17  normal  0.0950053 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3027  signal peptide protein  62.27 
 
 		 282 aa  348  5e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0193368  normal  0.0163712 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2960  signal peptide protein  64.14 
 
 		 280 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0142734 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3307  putative signal peptide protein  63.75 
 
 		 280 aa  342  4e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0281892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4998  hypothetical protein  54.96 
 
 		 270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1433  conserved hypothetical protein  50.4 
 
 		 258 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02152  hypothetical protein  50.4 
 
 		 258 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.5101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2366  hypothetical protein  50.4 
 
 		 258 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2521  hypothetical protein  50.79 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000025623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1425  hypothetical protein  50.4 
 
 		 258 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02111  hypothetical protein  50.4 
 
 		 258 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.529062  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3359  hypothetical protein  50 
 
 		 258 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.783819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58230  hypothetical protein  50.57 
 
 		 263 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5101  hypothetical protein  50.57 
 
 		 263 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2374  hypothetical protein  50.4 
 
 		 258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3308  putative signal peptide protein  43.15 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.027267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2961  putative signal peptide protein  43.15 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147846 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5003  hypothetical protein  42.02 
 
 		 263 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3028  putative signal peptide protein  42.39 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0370173  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5106  hypothetical protein  40.51 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58290  hypothetical protein  40.51 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6589  putative signal peptide protein  40.25 
 
 		 296 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000228235  normal  0.0148765 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16980  uncharacterized conserved protein (DUF2135)  37.39 
 
 		 1115 aa  85.1  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1819  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  37.29 
 
 		 963 aa  83.2  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.541917  normal  0.345133 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1093  hypothetical protein  30.36 
 
 		 583 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0295  vault protein inter-alpha-trypsin  35.11 
 
 		 995 aa  77.8  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00370516  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3164  hypothetical protein  42.17 
 
 		 1120 aa  72.8  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2477  hypothetical protein  33.62 
 
 		 992 aa  70.1  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184778  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3062  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  33.64 
 
 		 984 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2860  hypothetical protein  43.06 
 
 		 1066 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.27882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0719  hypothetical protein  62 
 
 		 56 aa  65.5  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233252  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4001  hypothetical protein  29.91 
 
 		 959 aa  56.6  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000175491  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0152  hypothetical protein  46.58 
 
 		 586 aa  53.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.621521  hitchhiker  0.000148726 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3152  hypothetical protein  39.76 
 
 		 446 aa  52.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1877  hypothetical protein  27.62 
 
 		 377 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0988168  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0944  hypothetical protein  27.62 
 
 		 377 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00926262  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3829  hypothetical protein  28.57 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3096  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 389 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1948  hypothetical protein  44.23 
 
 		 669 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247552  normal  0.114071 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2844  hypothetical protein  30.6 
 
 		 652 aa  42.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0262181  normal  0.628109 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>