26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1877 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0944  hypothetical protein  96.82 
 
 		 377 aa  718    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00926262  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1877  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  768    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0988168  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3829  hypothetical protein  95.24 
 
 		 336 aa  656    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3096  TPR repeat-containing protein  43.57 
 
 		 389 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1240  TPR repeat-containing protein  44.29 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.280897  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3828  hypothetical protein  50.59 
 
 		 102 aa  86.7  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2844  hypothetical protein  37.82 
 
 		 652 aa  79.7  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0262181  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2960  signal peptide protein  33.94 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0142734 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3307  putative signal peptide protein  33.03 
 
 		 280 aa  53.1  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0281892 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1433  conserved hypothetical protein  32.38 
 
 		 258 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02111  hypothetical protein  32.38 
 
 		 258 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.529062  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1425  hypothetical protein  32.38 
 
 		 258 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2366  hypothetical protein  32.38 
 
 		 258 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3027  signal peptide protein  31.43 
 
 		 282 aa  49.7  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0193368  normal  0.0163712 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02152  hypothetical protein  32.38 
 
 		 258 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.5101  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2521  hypothetical protein  31.43 
 
 		 258 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000025623  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3359  hypothetical protein  31.43 
 
 		 258 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.783819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2571  hypothetical protein  27.13 
 
 		 270 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  3.51589e-17  normal  0.0950053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6588  hypothetical protein  27.62 
 
 		 271 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683037  normal  0.0152413 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3152  hypothetical protein  38.83 
 
 		 446 aa  46.2  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4998  hypothetical protein  37.5 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2477  hypothetical protein  31.58 
 
 		 992 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184778  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5101  hypothetical protein  31.58 
 
 		 263 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58230  hypothetical protein  31.58 
 
 		 263 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16980  uncharacterized conserved protein (DUF2135)  25.87 
 
 		 1115 aa  43.9  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2374  hypothetical protein  32.38 
 
 		 258 aa  43.9  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>