17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2844 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2844  hypothetical protein  100 
 
 		 652 aa  1309    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0262181  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3953  hypothetical protein  28.57 
 
 		 596 aa  85.5  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.584499  normal  0.585033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3829  hypothetical protein  32.91 
 
 		 336 aa  80.1  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0944  hypothetical protein  37.5 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00926262  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1877  hypothetical protein  32.91 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0988168  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0988  hypothetical protein  32.9 
 
 		 990 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.318965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3071  PKD domain containing protein  29.91 
 
 		 1067 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192813  normal  0.491387 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4742  hypothetical protein  26.78 
 
 		 638 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.681757 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3096  TPR repeat-containing protein  34.96 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1240  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.280897  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0815  hypothetical protein  25.81 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0109394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  33.58 
 
 		 1147 aa  62.4  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3152  hypothetical protein  36.19 
 
 		 446 aa  47.4  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0127  putative hemagglutinin-related protein  26.67 
 
 		 480 aa  47  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 615 aa  46.2  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.965283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2089  hypothetical protein  32.91 
 
 		 850 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3164  hypothetical protein  34.57 
 
 		 1120 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875829  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>