58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3096 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3096  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 389 aa  797    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1240  TPR repeat-containing protein  94.07 
 
 		 389 aa  757    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.280897  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3829  hypothetical protein  46.03 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1877  hypothetical protein  43.57 
 
 		 377 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0988168  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0944  hypothetical protein  43.57 
 
 		 377 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00926262  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2844  hypothetical protein  34.96 
 
 		 652 aa  67.4  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0262181  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.21 
 
 		 810 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 		 878 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3152  hypothetical protein  34.74 
 
 		 446 aa  56.2  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58230  hypothetical protein  27.78 
 
 		 263 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5101  hypothetical protein  27.78 
 
 		 263 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2960  signal peptide protein  28.7 
 
 		 280 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0142734 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3307  putative signal peptide protein  28.7 
 
 		 280 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0281892 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  28.97 
 
 		 550 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 573 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 4079 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 		 3301 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 3172 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4998  hypothetical protein  27.97 
 
 		 270 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.41 
 
 		 632 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 750 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 593 aa  47  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0957  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 161 aa  46.6  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000843973  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3027  signal peptide protein  25.22 
 
 		 282 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0193368  normal  0.0163712 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0152  hypothetical protein  31.36 
 
 		 586 aa  46.2  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.621521  hitchhiker  0.000148726 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2961  putative signal peptide protein  25.95 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3308  putative signal peptide protein  25.95 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.027267 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58290  hypothetical protein  35.38 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 611 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5106  hypothetical protein  35.38 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1092  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase  27.35 
 
 		 584 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.962322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1212 aa  45.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.94 
 
 		 624 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  25.38 
 
 		 864 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 3145 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  33.33 
 
 		 514 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  30.77 
 
 		 1040 aa  44.3  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 187 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 583 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 637 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 718 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2571  hypothetical protein  25.22 
 
 		 270 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  3.51589e-17  normal  0.0950053 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  30.71 
 
 		 780 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.36 
 
 		 212 aa  43.9  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 313 aa  43.9  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6588  hypothetical protein  25.22 
 
 		 271 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683037  normal  0.0152413 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.85 
 
 		 733 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.11 
 
 		 725 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  32.1 
 
 		 1061 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 649 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 		 1737 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23400  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 		 183 aa  43.1  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000457247  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 		 957 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2352  tetratricopeptide TPR_2  39.44 
 
 		 201 aa  43.1  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.205488 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 217 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 828 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  31.91 
 
 		 603 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>