43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2960 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2960  signal peptide protein  100 
 
 		 280 aa  570  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0142734 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3307  putative signal peptide protein  99.64 
 
 		 280 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0281892 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3027  signal peptide protein  85.82 
 
 		 282 aa  498  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0193368  normal  0.0163712 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2571  hypothetical protein  60.51 
 
 		 270 aa  349  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  3.51589e-17  normal  0.0950053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6588  hypothetical protein  64.26 
 
 		 271 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683037  normal  0.0152413 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1433  conserved hypothetical protein  48.7 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02111  hypothetical protein  48.7 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.529062  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1425  hypothetical protein  48.7 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2521  hypothetical protein  48.7 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000025623  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2366  hypothetical protein  48.7 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02152  hypothetical protein  48.7 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.5101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3359  hypothetical protein  48.7 
 
 		 258 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.783819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58230  hypothetical protein  48.01 
 
 		 263 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4998  hypothetical protein  48.39 
 
 		 270 aa  256  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5101  hypothetical protein  47.65 
 
 		 263 aa  255  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2374  hypothetical protein  49.44 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2961  putative signal peptide protein  40.23 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147846 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3028  putative signal peptide protein  40.31 
 
 		 267 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0370173  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3308  putative signal peptide protein  39.84 
 
 		 267 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.027267 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5003  hypothetical protein  39.48 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58290  hypothetical protein  38.61 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5106  hypothetical protein  38.61 
 
 		 269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6589  putative signal peptide protein  37.74 
 
 		 296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000228235  normal  0.0148765 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1819  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  39.5 
 
 		 963 aa  94.7  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.541917  normal  0.345133 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16980  uncharacterized conserved protein (DUF2135)  40 
 
 		 1115 aa  90.1  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0295  vault protein inter-alpha-trypsin  32.65 
 
 		 995 aa  81.6  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00370516  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1093  hypothetical protein  34.1 
 
 		 583 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3164  hypothetical protein  35.48 
 
 		 1120 aa  75.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2477  hypothetical protein  36.52 
 
 		 992 aa  73.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184778  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3062  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  32.38 
 
 		 984 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2860  hypothetical protein  41.67 
 
 		 1066 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.27882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0719  hypothetical protein  54 
 
 		 56 aa  63.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233252  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3152  hypothetical protein  38.64 
 
 		 446 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1877  hypothetical protein  33.94 
 
 		 377 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0988168  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0944  hypothetical protein  33.03 
 
 		 377 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00926262  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3829  hypothetical protein  33.03 
 
 		 336 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3096  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0152  hypothetical protein  41.1 
 
 		 586 aa  49.3  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.621521  hitchhiker  0.000148726 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4051  hypothetical protein  36.67 
 
 		 418 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.749152  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1240  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 389 aa  47  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.280897  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4001  hypothetical protein  32.67 
 
 		 959 aa  46.6  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000175491  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3213  hypothetical protein  37.37 
 
 		 385 aa  46.2  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1948  hypothetical protein  46.81 
 
 		 669 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247552  normal  0.114071 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>