40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1425 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1433  conserved hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  535  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02111  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.529062  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1425  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  535  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2521  hypothetical protein  99.22 
 
 
258 aa  534  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000025623  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2366  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  535  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02152  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.5101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3359  hypothetical protein  99.22 
 
 
258 aa  532  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.783819  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2374  hypothetical protein  98.06 
 
 
258 aa  526  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5101  hypothetical protein  53.73 
 
 
263 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4998  hypothetical protein  54.68 
 
 
270 aa  279  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58230  hypothetical protein  52.61 
 
 
263 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3307  putative signal peptide protein  50.81 
 
 
280 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0281892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2960  signal peptide protein  50.81 
 
 
280 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0142734 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3027  signal peptide protein  52.02 
 
 
282 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0193368  normal  0.0163712 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2571  hypothetical protein  49.8 
 
 
270 aa  255  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  3.51589e-17  normal  0.0950053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6588  hypothetical protein  51.71 
 
 
271 aa  251  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683037  normal  0.0152413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5003  hypothetical protein  39.62 
 
 
263 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5106  hypothetical protein  39.59 
 
 
269 aa  184  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58290  hypothetical protein  39.59 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3028  putative signal peptide protein  38.84 
 
 
267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0370173  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2961  putative signal peptide protein  39.75 
 
 
267 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0147846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3308  putative signal peptide protein  39.34 
 
 
267 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.027267 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6589  putative signal peptide protein  37.33 
 
 
296 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000228235  normal  0.0148765 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0719  hypothetical protein  100 
 
 
56 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233252  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1819  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  41.03 
 
 
963 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.541917  normal  0.345133 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0295  vault protein inter-alpha-trypsin  40.68 
 
 
995 aa  95.5  8e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00370516  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16980  uncharacterized conserved protein (DUF2135)  38.66 
 
 
1115 aa  93.2  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2477  hypothetical protein  36.75 
 
 
992 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184778  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3164  hypothetical protein  36.45 
 
 
1120 aa  73.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875829  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1093  hypothetical protein  30.54 
 
 
583 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3062  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  32.73 
 
 
984 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4001  hypothetical protein  32.76 
 
 
959 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000175491  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2860  hypothetical protein  39.73 
 
 
1066 aa  65.9  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.27882  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3152  hypothetical protein  36.7 
 
 
446 aa  57  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3829  hypothetical protein  31.19 
 
 
336 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0944  hypothetical protein  31.19 
 
 
377 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00926262  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1877  hypothetical protein  32.38 
 
 
377 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0988168  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1948  hypothetical protein  31.82 
 
 
669 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247552  normal  0.114071 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0152  hypothetical protein  35.44 
 
 
586 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.621521  hitchhiker  0.000148726 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3096  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
389 aa  42  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>