44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3152 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3152  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  918    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0152  hypothetical protein  29.77 
 
 		 586 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.621521  hitchhiker  0.000148726 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0262  membrane protein  27.88 
 
 		 451 aa  97.1  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.442458  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3015  hypothetical protein  26.99 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2078  hypothetical protein  26.99 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0290  hypothetical protein  26.99 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3332  hypothetical protein  26.99 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0485  hypothetical protein  26.99 
 
 		 277 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0303  hypothetical protein  26.99 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0261  hypothetical protein  26.46 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3027  signal peptide protein  42.05 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0193368  normal  0.0163712 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3359  hypothetical protein  39.39 
 
 		 258 aa  57  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.783819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2366  hypothetical protein  36.7 
 
 		 258 aa  57  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1948  hypothetical protein  40.26 
 
 		 669 aa  57  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247552  normal  0.114071 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1433  conserved hypothetical protein  36.7 
 
 		 258 aa  57  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2521  hypothetical protein  36.7 
 
 		 258 aa  57  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000025623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1425  hypothetical protein  36.7 
 
 		 258 aa  57  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02111  hypothetical protein  36.7 
 
 		 258 aa  57  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.529062  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02152  hypothetical protein  36.7 
 
 		 258 aa  57  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.5101  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3096  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1240  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.280897  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5101  hypothetical protein  42.47 
 
 		 263 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58230  hypothetical protein  42.47 
 
 		 263 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2960  signal peptide protein  38.64 
 
 		 280 aa  53.9  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0142734 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4998  hypothetical protein  35.45 
 
 		 270 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2571  hypothetical protein  39.76 
 
 		 270 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  3.51589e-17  normal  0.0950053 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3307  putative signal peptide protein  37.8 
 
 		 280 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0281892 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6588  hypothetical protein  39.76 
 
 		 271 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683037  normal  0.0152413 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2477  hypothetical protein  31.82 
 
 		 992 aa  51.2  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184778  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0133  hypothetical protein  24.77 
 
 		 483 aa  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2844  hypothetical protein  41.77 
 
 		 652 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0262181  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2374  hypothetical protein  33.03 
 
 		 258 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0944  hypothetical protein  38.83 
 
 		 377 aa  47  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00926262  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1877  hypothetical protein  38.83 
 
 		 377 aa  46.6  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0988168  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1819  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  32.29 
 
 		 963 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.541917  normal  0.345133 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2860  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1066 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.27882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3164  hypothetical protein  37.29 
 
 		 1120 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16980  uncharacterized conserved protein (DUF2135)  30.85 
 
 		 1115 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3829  hypothetical protein  34.95 
 
 		 336 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  33.33 
 
 		 899 aa  44.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5003  hypothetical protein  36.62 
 
 		 263 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1093  hypothetical protein  36.23 
 
 		 583 aa  44.3  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5106  hypothetical protein  36.62 
 
 		 269 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58290  hypothetical protein  36.62 
 
 		 269 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>