46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1093 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1093  hypothetical protein  100 
 
 		 583 aa  1200    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0927  hypothetical protein  29.81 
 
 		 283 aa  90.1  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106716 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5104  hypothetical protein  35.68 
 
 		 212 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58260  hypothetical protein  35.55 
 
 		 212 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5001  hypothetical protein  34.65 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.521864  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1809  hypothetical protein  28.25 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.47827  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1755  hypothetical protein  27.76 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2377  hypothetical protein  30.57 
 
 		 207 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.280114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4998  hypothetical protein  28.52 
 
 		 270 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58230  hypothetical protein  28.15 
 
 		 263 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3027  signal peptide protein  33.53 
 
 		 282 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0193368  normal  0.0163712 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6588  hypothetical protein  29.52 
 
 		 271 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683037  normal  0.0152413 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3307  putative signal peptide protein  34.1 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0281892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2960  signal peptide protein  34.1 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0142734 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2571  hypothetical protein  30.36 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  3.51589e-17  normal  0.0950053 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1422  hypothetical protein  30.05 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.12888  hitchhiker  0.0000113323 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3363  hypothetical protein  30.05 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1430  protein of unknown function DUF1175  30.05 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133714  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5101  hypothetical protein  27.78 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02114  hypothetical protein  30.05 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02155  hypothetical protein  30.05 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2524  hypothetical protein  30.05 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2574  hypothetical protein  31.58 
 
 		 257 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.165739 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2369  hypothetical protein  29.53 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6592  protein of unknown function DUF1175  32.06 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191947  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02111  hypothetical protein  30.3 
 
 		 258 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.529062  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1425  hypothetical protein  30.3 
 
 		 258 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2366  hypothetical protein  30.3 
 
 		 258 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02152  hypothetical protein  30.3 
 
 		 258 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.5101  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1433  conserved hypothetical protein  30.3 
 
 		 258 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2521  hypothetical protein  30.3 
 
 		 258 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000025623  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3311  protein of unknown function DUF1175  32.18 
 
 		 234 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.956301  normal  0.102999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3031  hypothetical protein  33.17 
 
 		 241 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0310566  normal  0.0597256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2964  protein of unknown function DUF1175  32.18 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0748303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3359  hypothetical protein  29.7 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.783819  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3028  putative signal peptide protein  31.14 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0370173  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3308  putative signal peptide protein  31.14 
 
 		 267 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.027267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2961  putative signal peptide protein  31.14 
 
 		 267 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147846 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2374  hypothetical protein  32.16 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5003  hypothetical protein  31.11 
 
 		 263 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0138  hypothetical protein  27.44 
 
 		 207 aa  58.9  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5106  hypothetical protein  30.51 
 
 		 269 aa  57  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58290  hypothetical protein  30.51 
 
 		 269 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3164  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1120 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6589  putative signal peptide protein  25.15 
 
 		 296 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000228235  normal  0.0148765 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3152  hypothetical protein  36.23 
 
 		 446 aa  44.3  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>