21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5001 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5001  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.521864  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5104  hypothetical protein  85.86 
 
 		 212 aa  350  8e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58260  hypothetical protein  83.25 
 
 		 212 aa  350  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02114  hypothetical protein  70.79 
 
 		 207 aa  318  5e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02155  hypothetical protein  70.79 
 
 		 207 aa  318  5e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1422  hypothetical protein  69.61 
 
 		 207 aa  317  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.12888  hitchhiker  0.0000113323 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3363  hypothetical protein  69.61 
 
 		 207 aa  317  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1430  protein of unknown function DUF1175  69.61 
 
 		 207 aa  317  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133714  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2524  hypothetical protein  69.61 
 
 		 207 aa  314  5e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2377  hypothetical protein  68.14 
 
 		 207 aa  314  5e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.280114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2369  hypothetical protein  69.12 
 
 		 207 aa  312  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6592  protein of unknown function DUF1175  57.56 
 
 		 327 aa  260  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191947  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2964  protein of unknown function DUF1175  64.21 
 
 		 234 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0748303 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3311  protein of unknown function DUF1175  63.16 
 
 		 234 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.956301  normal  0.102999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3031  hypothetical protein  64.21 
 
 		 241 aa  258  6e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0310566  normal  0.0597256 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2574  hypothetical protein  57.42 
 
 		 257 aa  254  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.165739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0927  hypothetical protein  35.24 
 
 		 283 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106716 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0138  hypothetical protein  29.11 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1755  hypothetical protein  30.92 
 
 		 293 aa  95.9  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1809  hypothetical protein  31.07 
 
 		 312 aa  95.5  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.47827  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1093  hypothetical protein  34.65 
 
 		 583 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>