21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2369 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2369  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  435  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2524  hypothetical protein  99.52 
 
 
207 aa  432  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1430  protein of unknown function DUF1175  98.55 
 
 
207 aa  428  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133714  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3363  hypothetical protein  98.55 
 
 
207 aa  428  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1422  hypothetical protein  98.55 
 
 
207 aa  428  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.12888  hitchhiker  0.0000113323 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02114  hypothetical protein  97.58 
 
 
207 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02155  hypothetical protein  97.58 
 
 
207 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2377  hypothetical protein  96.14 
 
 
207 aa  421  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.280114  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5104  hypothetical protein  73.66 
 
 
212 aa  308  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58260  hypothetical protein  73.66 
 
 
212 aa  308  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5001  hypothetical protein  71.2 
 
 
212 aa  303  9.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.521864  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3311  protein of unknown function DUF1175  59.02 
 
 
234 aa  269  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.956301  normal  0.102999 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2964  protein of unknown function DUF1175  59.51 
 
 
234 aa  268  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0748303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3031  hypothetical protein  59.62 
 
 
241 aa  265  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0310566  normal  0.0597256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6592  protein of unknown function DUF1175  57.37 
 
 
327 aa  258  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191947  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2574  hypothetical protein  57.37 
 
 
257 aa  255  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.165739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0927  hypothetical protein  33.84 
 
 
283 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106716 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0138  hypothetical protein  33.51 
 
 
207 aa  100  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1755  hypothetical protein  30.58 
 
 
293 aa  99.8  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1809  hypothetical protein  30.58 
 
 
312 aa  99.4  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.47827  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1093  hypothetical protein  29.53 
 
 
583 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>