21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2964 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2964  protein of unknown function DUF1175  100 
 
 		 234 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0748303 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3311  protein of unknown function DUF1175  97.44 
 
 		 234 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.956301  normal  0.102999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3031  hypothetical protein  88.31 
 
 		 241 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0310566  normal  0.0597256 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2574  hypothetical protein  69.92 
 
 		 257 aa  333  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.165739 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6592  protein of unknown function DUF1175  72.6 
 
 		 327 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191947  normal  0.10603 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1430  protein of unknown function DUF1175  60 
 
 		 207 aa  276  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133714  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3363  hypothetical protein  60 
 
 		 207 aa  276  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1422  hypothetical protein  60 
 
 		 207 aa  276  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.12888  hitchhiker  0.0000113323 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02114  hypothetical protein  59.51 
 
 		 207 aa  275  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02155  hypothetical protein  59.51 
 
 		 207 aa  275  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2524  hypothetical protein  60 
 
 		 207 aa  275  4e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2377  hypothetical protein  59.51 
 
 		 207 aa  275  5e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.280114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2369  hypothetical protein  59.51 
 
 		 207 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5104  hypothetical protein  64.92 
 
 		 212 aa  266  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58260  hypothetical protein  64.92 
 
 		 212 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5001  hypothetical protein  63.08 
 
 		 212 aa  262  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.521864  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0927  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106716 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1755  hypothetical protein  32.55 
 
 		 293 aa  98.6  8e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1809  hypothetical protein  32.55 
 
 		 312 aa  97.8  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.47827  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0138  hypothetical protein  28.36 
 
 		 207 aa  85.1  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1093  hypothetical protein  32.18 
 
 		 583 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>