27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6589 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6589  putative signal peptide protein  100 
 
 		 296 aa  607  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000228235  normal  0.0148765 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3308  putative signal peptide protein  65.9 
 
 		 267 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.027267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3028  putative signal peptide protein  69.14 
 
 		 267 aa  355  2.9999999999999997e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0370173  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2961  putative signal peptide protein  65.9 
 
 		 267 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147846 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5003  hypothetical protein  56.49 
 
 		 263 aa  289  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5106  hypothetical protein  53.56 
 
 		 269 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58290  hypothetical protein  53.56 
 
 		 269 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2571  hypothetical protein  39.48 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  3.51589e-17  normal  0.0950053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6588  hypothetical protein  39.83 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683037  normal  0.0152413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4998  hypothetical protein  37.88 
 
 		 270 aa  168  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3307  putative signal peptide protein  37.22 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0281892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2960  signal peptide protein  37.22 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0142734 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3027  signal peptide protein  35.19 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0193368  normal  0.0163712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5101  hypothetical protein  40.34 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58230  hypothetical protein  39.91 
 
 		 263 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2521  hypothetical protein  37.33 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000025623  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02111  hypothetical protein  37.33 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.529062  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1433  conserved hypothetical protein  37.33 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1425  hypothetical protein  37.33 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2366  hypothetical protein  37.33 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02152  hypothetical protein  37.33 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.5101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3359  hypothetical protein  36.87 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.783819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2374  hypothetical protein  37.33 
 
 		 258 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16980  uncharacterized conserved protein (DUF2135)  25 
 
 		 1115 aa  53.5  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1093  hypothetical protein  25.7 
 
 		 583 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0719  hypothetical protein  39.34 
 
 		 56 aa  47  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233252  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1819  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  25.81 
 
 		 963 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.541917  normal  0.345133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>