24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0719 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0719  hypothetical protein  100 
 
 		 56 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233252  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2374  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2521  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000025623  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02111  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.529062  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3359  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.783819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1425  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02152  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.5101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2366  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1433  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5101  hypothetical protein  52.46 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58230  hypothetical protein  52.46 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4998  hypothetical protein  57.38 
 
 		 270 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3027  signal peptide protein  58 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0193368  normal  0.0163712 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2571  hypothetical protein  62 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  3.51589e-17  normal  0.0950053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6588  hypothetical protein  62 
 
 		 271 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683037  normal  0.0152413 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3307  putative signal peptide protein  54 
 
 		 280 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0281892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2960  signal peptide protein  54 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0142734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58290  hypothetical protein  46 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5106  hypothetical protein  46 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5003  hypothetical protein  46 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3028  putative signal peptide protein  40.98 
 
 		 267 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0370173  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6589  putative signal peptide protein  39.34 
 
 		 296 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000228235  normal  0.0148765 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3308  putative signal peptide protein  40.98 
 
 		 267 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.027267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2961  putative signal peptide protein  40.98 
 
 		 267 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>