36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_58290 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_58290  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5106  hypothetical protein  99.63 
 
 		 269 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5003  hypothetical protein  68.36 
 
 		 263 aa  360  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3028  putative signal peptide protein  52.87 
 
 		 267 aa  279  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0370173  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2961  putative signal peptide protein  52.05 
 
 		 267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3308  putative signal peptide protein  51.64 
 
 		 267 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.027267 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6589  putative signal peptide protein  53.59 
 
 		 296 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000228235  normal  0.0148765 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1433  conserved hypothetical protein  39.59 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02152  hypothetical protein  39.59 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.5101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1425  hypothetical protein  39.59 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2521  hypothetical protein  39.59 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000025623  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2366  hypothetical protein  39.59 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02111  hypothetical protein  39.59 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.529062  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2571  hypothetical protein  40.98 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  3.51589e-17  normal  0.0950053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4998  hypothetical protein  40.24 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3359  hypothetical protein  39.18 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.783819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6588  hypothetical protein  42.11 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683037  normal  0.0152413 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3027  signal peptide protein  39.38 
 
 		 282 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0193368  normal  0.0163712 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3307  putative signal peptide protein  38.61 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0281892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2960  signal peptide protein  38.61 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0142734 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2374  hypothetical protein  39.59 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5101  hypothetical protein  40.16 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58230  hypothetical protein  40.55 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1819  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.46 
 
 		 963 aa  56.6  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.541917  normal  0.345133 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1093  hypothetical protein  30.51 
 
 		 583 aa  56.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0719  hypothetical protein  46 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233252  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2860  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1066 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.27882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2477  hypothetical protein  25.32 
 
 		 992 aa  53.5  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184778  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16980  uncharacterized conserved protein (DUF2135)  30.99 
 
 		 1115 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0295  vault protein inter-alpha-trypsin  29.59 
 
 		 995 aa  50.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00370516  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3164  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1120 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3062  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.27 
 
 		 984 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3096  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 		 389 aa  44.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3152  hypothetical protein  36.62 
 
 		 446 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1240  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 		 389 aa  43.5  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.280897  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4001  hypothetical protein  20.45 
 
 		 959 aa  42.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000175491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>