55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3164 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3164  hypothetical protein  100 
 
 		 1120 aa  2208    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0295  vault protein inter-alpha-trypsin  24.49 
 
 		 995 aa  101  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00370516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4001  hypothetical protein  20.53 
 
 		 959 aa  89  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000175491  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1819  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.52 
 
 		 963 aa  77.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.541917  normal  0.345133 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3062  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  29.33 
 
 		 984 aa  75.9  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  24.5 
 
 		 775 aa  75.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2960  signal peptide protein  35.48 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0142734 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3359  hypothetical protein  37.25 
 
 		 258 aa  74.3  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.783819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2521  hypothetical protein  37.25 
 
 		 258 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000025623  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1433  conserved hypothetical protein  37.25 
 
 		 258 aa  73.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02111  hypothetical protein  37.25 
 
 		 258 aa  73.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.529062  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3307  putative signal peptide protein  40 
 
 		 280 aa  73.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0281892 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1425  hypothetical protein  37.25 
 
 		 258 aa  73.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2366  hypothetical protein  37.25 
 
 		 258 aa  73.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2477  hypothetical protein  26.69 
 
 		 992 aa  73.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184778  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3027  signal peptide protein  41.05 
 
 		 282 aa  73.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0193368  normal  0.0163712 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02152  hypothetical protein  37.25 
 
 		 258 aa  73.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.5101  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6588  hypothetical protein  42.17 
 
 		 271 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683037  normal  0.0152413 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2571  hypothetical protein  42.17 
 
 		 270 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  3.51589e-17  normal  0.0950053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58230  hypothetical protein  35.79 
 
 		 263 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5101  hypothetical protein  35.79 
 
 		 263 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4998  hypothetical protein  39.51 
 
 		 270 aa  65.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  23.49 
 
 		 750 aa  63.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.09 
 
 		 755 aa  63.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.48 
 
 		 791 aa  62.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16980  uncharacterized conserved protein (DUF2135)  37.8 
 
 		 1115 aa  62.8  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.81 
 
 		 794 aa  60.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.33 
 
 		 740 aa  60.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2374  hypothetical protein  36.45 
 
 		 258 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  27.78 
 
 		 713 aa  60.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  30.63 
 
 		 819 aa  59.7  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.69 
 
 		 1033 aa  56.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30 
 
 		 795 aa  55.5  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  27.27 
 
 		 701 aa  54.3  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.47 
 
 		 723 aa  51.6  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58290  hypothetical protein  37.5 
 
 		 269 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5106  hypothetical protein  37.5 
 
 		 269 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1093  hypothetical protein  26.6 
 
 		 583 aa  50.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.32 
 
 		 786 aa  49.3  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4959  hypothetical protein  30.89 
 
 		 826 aa  48.9  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0521836  normal  0.194577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6186  Tetratricopeptide TPR_4  37.01 
 
 		 2910 aa  48.9  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5003  hypothetical protein  28.85 
 
 		 263 aa  48.5  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2961  putative signal peptide protein  33.78 
 
 		 267 aa  48.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  27.69 
 
 		 774 aa  48.5  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3308  putative signal peptide protein  33.78 
 
 		 267 aa  48.1  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.027267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3028  putative signal peptide protein  32.43 
 
 		 267 aa  47.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0370173  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.69 
 
 		 732 aa  47.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  26.47 
 
 		 831 aa  47  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2860  hypothetical protein  32.39 
 
 		 1066 aa  46.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.27882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  33.33 
 
 		 899 aa  46.6  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  29.03 
 
 		 761 aa  46.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.7 
 
 		 712 aa  45.8  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3152  hypothetical protein  37.29 
 
 		 446 aa  45.4  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  27.36 
 
 		 760 aa  45.1  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2844  hypothetical protein  34.57 
 
 		 652 aa  45.1  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0262181  normal  0.628109 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>