121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2738 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  55.71 
 
 
755 aa  675    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  53.42 
 
 
750 aa  657    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  54.1 
 
 
755 aa  668    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  100 
 
 
794 aa  1610    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  88.79 
 
 
791 aa  1298    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  54.25 
 
 
732 aa  616  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  53.06 
 
 
723 aa  619  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  53.42 
 
 
738 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  52.15 
 
 
761 aa  598  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  50.22 
 
 
725 aa  587  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  46.84 
 
 
740 aa  563  1.0000000000000001e-159  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  49.51 
 
 
729 aa  534  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  35.51 
 
 
789 aa  438  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  40.34 
 
 
701 aa  434  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  38.93 
 
 
757 aa  422  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.76 
 
 
772 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  39.82 
 
 
751 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  39.09 
 
 
759 aa  415  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.76 
 
 
771 aa  416  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.76 
 
 
772 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  39.18 
 
 
755 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  38.34 
 
 
770 aa  412  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  36.5 
 
 
771 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.08 
 
 
722 aa  405  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.72 
 
 
712 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  35.92 
 
 
763 aa  396  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  36.99 
 
 
760 aa  391  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  37.58 
 
 
739 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.79 
 
 
776 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.44 
 
 
786 aa  327  7e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  35.81 
 
 
1362 aa  325  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  32.96 
 
 
819 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  33.14 
 
 
753 aa  296  7e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.95 
 
 
812 aa  287  4e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  32.95 
 
 
831 aa  286  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  34.99 
 
 
774 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.26 
 
 
701 aa  268  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  32.27 
 
 
711 aa  269  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.46 
 
 
691 aa  266  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  33.22 
 
 
796 aa  262  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.61 
 
 
795 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.84 
 
 
671 aa  241  5.999999999999999e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  28.21 
 
 
776 aa  231  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.21 
 
 
1033 aa  228  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  27.04 
 
 
713 aa  163  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  24.83 
 
 
775 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  27.39 
 
 
833 aa  158  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.09 
 
 
680 aa  145  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  27.03 
 
 
840 aa  145  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  26.42 
 
 
1109 aa  106  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.95 
 
 
338 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  30.54 
 
 
479 aa  70.9  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  28.06 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  26.97 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  24.04 
 
 
418 aa  67.4  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  25.97 
 
 
419 aa  64.3  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  26.55 
 
 
420 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  28.98 
 
 
393 aa  63.9  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  25.39 
 
 
427 aa  62.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3164  hypothetical protein  27.81 
 
 
1120 aa  61.2  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875829  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  30.68 
 
 
419 aa  61.2  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  25.79 
 
 
416 aa  60.1  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  31.91 
 
 
425 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 
412 aa  58.9  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  31.03 
 
 
411 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  35.51 
 
 
903 aa  58.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  24.17 
 
 
423 aa  58.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  26.78 
 
 
412 aa  58.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  28.18 
 
 
421 aa  58.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  29.71 
 
 
570 aa  57.4  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  28.08 
 
 
459 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  28.81 
 
 
412 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  24.74 
 
 
462 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  28.74 
 
 
902 aa  55.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  27.44 
 
 
629 aa  56.2  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  29.52 
 
 
419 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  30.5 
 
 
425 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3001  von Willebrand factor type A  30.77 
 
 
365 aa  54.3  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1819  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  23.29 
 
 
963 aa  54.3  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.541917  normal  0.345133 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  27.6 
 
 
412 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  27.51 
 
 
418 aa  53.9  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  23.5 
 
 
363 aa  53.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  26.74 
 
 
546 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  29.35 
 
 
828 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  32.64 
 
 
589 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.18 
 
 
442 aa  52.4  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  24.9 
 
 
415 aa  52.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  29.84 
 
 
423 aa  51.6  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  28.57 
 
 
523 aa  51.2  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  29.06 
 
 
808 aa  50.8  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0400  von Willebrand factor type A  34.81 
 
 
476 aa  50.8  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  23.56 
 
 
412 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  22.86 
 
 
426 aa  50.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  26.6 
 
 
555 aa  50.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  29.94 
 
 
561 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  26.49 
 
 
547 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0295  vault protein inter-alpha-trypsin  26.72 
 
 
995 aa  49.7  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00370516  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  29.82 
 
 
918 aa  49.3  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  27.22 
 
 
430 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  26.8 
 
 
421 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>