20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3001 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3001  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 365 aa  737    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0806  von Willebrand factor type A  30.46 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.03 
 
 		 772 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  31.55 
 
 		 761 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.03 
 
 		 772 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  31.03 
 
 		 771 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.18 
 
 		 791 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.77 
 
 		 794 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.77 
 
 		 740 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  31.48 
 
 		 755 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  32.88 
 
 		 750 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.82 
 
 		 755 aa  50.8  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  27.39 
 
 		 757 aa  50.1  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.89 
 
 		 771 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.8 
 
 		 776 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  28.16 
 
 		 753 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.41 
 
 		 725 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.21 
 
 		 738 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.54 
 
 		 723 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3093  von Willebrand factor type A  24.16 
 
 		 340 aa  42.7  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.397727 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>