116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0664 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  100 
 
 		 755 aa  1511    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  53.97 
 
 		 750 aa  711    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  58.74 
 
 		 732 aa  689    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  56.82 
 
 		 729 aa  640    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  60.32 
 
 		 761 aa  729    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  58.91 
 
 		 723 aa  704    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  55.71 
 
 		 794 aa  664    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  59.22 
 
 		 738 aa  689    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  59.05 
 
 		 725 aa  705    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  56.47 
 
 		 791 aa  673    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  48.36 
 
 		 755 aa  633  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  46.61 
 
 		 740 aa  536  1e-151  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  38.01 
 
 		 701 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  36.89 
 
 		 757 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  40 
 
 		 751 aa  414  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.63 
 
 		 712 aa  413  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  39.45 
 
 		 755 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  39.19 
 
 		 771 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  39.34 
 
 		 772 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  39.51 
 
 		 759 aa  405  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  39.04 
 
 		 771 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  39.04 
 
 		 772 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  35.78 
 
 		 763 aa  398  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  35.75 
 
 		 789 aa  398  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  35.56 
 
 		 760 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  37.85 
 
 		 739 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.74 
 
 		 770 aa  382  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  35.52 
 
 		 722 aa  372  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.6 
 
 		 776 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  38.9 
 
 		 1362 aa  360  5e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.5 
 
 		 786 aa  319  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  34.23 
 
 		 753 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  32.01 
 
 		 819 aa  297  6e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  31.86 
 
 		 711 aa  260  6e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.59 
 
 		 701 aa  259  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  35.11 
 
 		 795 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  31.3 
 
 		 831 aa  249  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.64 
 
 		 812 aa  247  6e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.54 
 
 		 691 aa  246  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  33.86 
 
 		 774 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  33.92 
 
 		 1033 aa  236  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  31.16 
 
 		 796 aa  230  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.68 
 
 		 671 aa  224  4e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  29 
 
 		 776 aa  223  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  25.54 
 
 		 775 aa  145  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  28.27 
 
 		 833 aa  139  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  26.54 
 
 		 840 aa  137  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.16 
 
 		 680 aa  134  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  24.19 
 
 		 713 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  23.53 
 
 		 1109 aa  97.8  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  27.54 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  26.51 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  28.2 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 		 420 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  23.18 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  27.54 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  25.55 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  30.06 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  28.65 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  25 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.81 
 
 		 338 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  28.05 
 
 		 412 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  30.3 
 
 		 421 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  27.92 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  25.58 
 
 		 418 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  25.62 
 
 		 462 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  25.58 
 
 		 418 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  23.3 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  29.14 
 
 		 425 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  28.95 
 
 		 412 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  36.52 
 
 		 523 aa  60.1  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  26.98 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  27.31 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  31.45 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  29.14 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3093  von Willebrand factor type A  32.62 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  29.17 
 
 		 842 aa  57.8  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  28.76 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  28.5 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.23 
 
 		 442 aa  57  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  23.28 
 
 		 412 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  30.38 
 
 		 903 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  27.68 
 
 		 546 aa  56.6  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  29.57 
 
 		 561 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  33.61 
 
 		 942 aa  55.5  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  24.88 
 
 		 426 aa  54.7  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0368  von Willebrand factor type A  30.5 
 
 		 428 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00177271  decreased coverage  0.000715031 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  30.85 
 
 		 467 aa  53.9  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  30.81 
 
 		 1077 aa  53.9  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  24.62 
 
 		 902 aa  53.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  27.37 
 
 		 562 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  26.75 
 
 		 828 aa  52  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3001  von Willebrand factor type A  31.48 
 
 		 365 aa  52  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  26.4 
 
 		 550 aa  51.6  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  27.78 
 
 		 543 aa  50.8  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  25.99 
 
 		 547 aa  50.8  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  25.4 
 
 		 1188 aa  50.8  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  31.76 
 
 		 589 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  27.17 
 
 		 847 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  31.73 
 
 		 505 aa  48.9  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>