59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0368 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0368  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 428 aa  858    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00177271  decreased coverage  0.000715031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4946  von Willebrand factor type A  53.13 
 
 		 431 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0264631  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0183  von Willebrand factor type A  49.2 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3066  von Willebrand factor type A  46.65 
 
 		 425 aa  362  6e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000574906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2163  von Willebrand factor type A  45.75 
 
 		 440 aa  348  9e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.820546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4403  von Willebrand factor type A  47.1 
 
 		 450 aa  329  6e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4557  von Willebrand factor type A  41.03 
 
 		 425 aa  305  9.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal  0.659076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2461  von Willebrand factor type A  42 
 
 		 432 aa  269  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0207463  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2532  von Willebrand factor type A  40.71 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0400  von Willebrand factor type A  37.53 
 
 		 476 aa  226  6e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1137  serine/threonine protein kinase  37.4 
 
 		 962 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4249  hypothetical protein  68.28 
 
 		 145 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.832481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  32.33 
 
 		 761 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  25.55 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  28.24 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  30.5 
 
 		 755 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  24.65 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  27.97 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.82 
 
 		 755 aa  57  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.33 
 
 		 725 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  29.21 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.55 
 
 		 740 aa  54.7  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  28.51 
 
 		 427 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  25.29 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  27.36 
 
 		 415 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  28.02 
 
 		 418 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.03 
 
 		 723 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  24.12 
 
 		 467 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.86 
 
 		 738 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  30.56 
 
 		 739 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  26.34 
 
 		 479 aa  50.4  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  31.05 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  28.4 
 
 		 418 aa  50.1  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.47 
 
 		 751 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  29.55 
 
 		 1188 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  25.53 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.47 
 
 		 755 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  30.06 
 
 		 625 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  24.53 
 
 		 419 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  30.65 
 
 		 760 aa  47  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  31.71 
 
 		 753 aa  47  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  27.72 
 
 		 393 aa  47  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.69 
 
 		 732 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  32.26 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  29.51 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.78 
 
 		 759 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.67 
 
 		 712 aa  44.3  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  24.76 
 
 		 416 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 418 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  31.3 
 
 		 892 aa  43.9  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 418 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  34.48 
 
 		 1362 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  27.75 
 
 		 771 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.78 
 
 		 772 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.62 
 
 		 729 aa  43.5  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.78 
 
 		 772 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.27 
 
 		 786 aa  43.1  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4476  von Willebrand factor, type A  30.53 
 
 		 358 aa  43.1  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>