155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1972 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  84.73 
 
 		 851 aa  1349    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 847 aa  1654    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  47.89 
 
 		 842 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  41.65 
 
 		 828 aa  533  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  36.01 
 
 		 951 aa  345  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  32.77 
 
 		 918 aa  343  5e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  30.88 
 
 		 966 aa  326  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  31.28 
 
 		 972 aa  311  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  31.51 
 
 		 950 aa  297  5e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  31.8 
 
 		 936 aa  290  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  31.2 
 
 		 958 aa  282  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  30.64 
 
 		 914 aa  281  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  25.76 
 
 		 902 aa  278  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  28.08 
 
 		 888 aa  264  4.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  30.01 
 
 		 932 aa  262  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  30.95 
 
 		 903 aa  249  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4003  protein of unknown function DUF1355  26.91 
 
 		 1023 aa  243  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0902905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3926  von Willebrand factor type A  28.97 
 
 		 978 aa  239  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.501815  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1164  von Willebrand factor type A  26.49 
 
 		 859 aa  152  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.366027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  29.47 
 
 		 744 aa  139  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0801  hypothetical protein  25.8 
 
 		 813 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  27.3 
 
 		 717 aa  119  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1368  von Willebrand factor type A  28.43 
 
 		 788 aa  108  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.483102 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  37.04 
 
 		 412 aa  97.4  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0771  von Willebrand factor, type A  23.32 
 
 		 789 aa  92  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.65454  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  27.13 
 
 		 363 aa  76.3  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  32.26 
 
 		 607 aa  76.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  34.34 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  31.33 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  30.81 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  29.05 
 
 		 418 aa  73.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.9 
 
 		 442 aa  73.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  29.74 
 
 		 416 aa  73.9  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1935  hypothetical protein  22.34 
 
 		 828 aa  72.8  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.115216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  31.79 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  30.57 
 
 		 609 aa  72  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  30.72 
 
 		 412 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  29.34 
 
 		 418 aa  70.5  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  30.86 
 
 		 418 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  31.21 
 
 		 420 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0048  von Willebrand factor type A  29.38 
 
 		 474 aa  66.2  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  33.15 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  27.83 
 
 		 605 aa  65.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  30.29 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  30.05 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  30.29 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  27.59 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  27.72 
 
 		 479 aa  62  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  27.01 
 
 		 425 aa  62  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  27.64 
 
 		 561 aa  61.6  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  27.17 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.48 
 
 		 712 aa  61.2  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2646  hypothetical protein  23.59 
 
 		 877 aa  59.7  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0657655 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  34 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  31.64 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  27.11 
 
 		 771 aa  59.3  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.11 
 
 		 772 aa  59.3  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.11 
 
 		 772 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.49 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  28.49 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  26.69 
 
 		 618 aa  58.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  30.05 
 
 		 505 aa  58.2  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0004  von Willebrand factor, type A  27.92 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.67 
 
 		 771 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  28.25 
 
 		 393 aa  57.4  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  27.62 
 
 		 452 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25 
 
 		 451 aa  56.6  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  29.67 
 
 		 426 aa  56.6  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  31.78 
 
 		 602 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  27.14 
 
 		 562 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.93 
 
 		 472 aa  56.6  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  26.34 
 
 		 421 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.14 
 
 		 759 aa  55.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  30.65 
 
 		 601 aa  55.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  27.06 
 
 		 643 aa  55.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  28.49 
 
 		 1188 aa  54.7  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.15 
 
 		 722 aa  54.3  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.54 
 
 		 738 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.71 
 
 		 755 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.71 
 
 		 751 aa  54.3  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  24.35 
 
 		 412 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.24 
 
 		 732 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  27.35 
 
 		 892 aa  53.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  26.34 
 
 		 757 aa  52.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  27.87 
 
 		 490 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  28.32 
 
 		 562 aa  52.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  25.68 
 
 		 412 aa  52  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  26.06 
 
 		 415 aa  52.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  25.31 
 
 		 760 aa  52  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.59 
 
 		 776 aa  52  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.32 
 
 		 755 aa  51.6  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  29.17 
 
 		 761 aa  51.6  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  30.43 
 
 		 774 aa  51.6  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  27.88 
 
 		 775 aa  51.6  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.57 
 
 		 723 aa  51.6  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  30.72 
 
 		 547 aa  50.8  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  24.17 
 
 		 763 aa  50.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.35 
 
 		 729 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  28.65 
 
 		 640 aa  50.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>