19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2646 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2646  hypothetical protein  100 
 
 
877 aa  1806    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0657655 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0801  hypothetical protein  34.96 
 
 
813 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1935  hypothetical protein  35.96 
 
 
828 aa  465  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.115216  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0771  von Willebrand factor, type A  31.98 
 
 
789 aa  302  2e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.65454  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1368  von Willebrand factor type A  26.42 
 
 
788 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.483102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  24.28 
 
 
828 aa  84.3  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  22.55 
 
 
903 aa  82.8  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  23.4 
 
 
847 aa  76.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  23.61 
 
 
950 aa  67.4  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  25.09 
 
 
888 aa  67.4  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3926  von Willebrand factor type A  23.42 
 
 
978 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.501815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  23.05 
 
 
851 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  25.67 
 
 
936 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  22.3 
 
 
958 aa  57.4  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  20.65 
 
 
914 aa  56.2  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  21.11 
 
 
842 aa  55.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  26.67 
 
 
951 aa  50.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  25.58 
 
 
932 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1164  von Willebrand factor type A  31.15 
 
 
859 aa  46.2  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.366027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>