60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1368 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1368  von Willebrand factor type A  100 
 
 
788 aa  1550    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.483102 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0771  von Willebrand factor, type A  28.81 
 
 
789 aa  231  3e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.65454  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0801  hypothetical protein  28.64 
 
 
813 aa  227  8e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1935  hypothetical protein  26.81 
 
 
828 aa  208  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.115216  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2646  hypothetical protein  26.03 
 
 
877 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0657655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  28.07 
 
 
847 aa  114  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  22.06 
 
 
888 aa  106  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  26.46 
 
 
851 aa  104  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  24.43 
 
 
951 aa  99  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  28.16 
 
 
828 aa  93.6  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  26.81 
 
 
903 aa  82.4  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  25.46 
 
 
966 aa  82.4  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  25.07 
 
 
902 aa  81.6  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  26.29 
 
 
958 aa  81.3  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  26.18 
 
 
972 aa  77.8  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  24.52 
 
 
950 aa  74.3  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  24.88 
 
 
918 aa  73.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  28.34 
 
 
717 aa  70.9  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  24.9 
 
 
842 aa  68.6  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3926  von Willebrand factor type A  24.83 
 
 
978 aa  67.4  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.501815  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  28.43 
 
 
643 aa  65.1  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1164  von Willebrand factor type A  25.15 
 
 
859 aa  64.7  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.366027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  24.16 
 
 
914 aa  64.7  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  24.4 
 
 
936 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.88 
 
 
451 aa  55.5  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  30.7 
 
 
308 aa  55.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  27.05 
 
 
421 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  26 
 
 
795 aa  51.6  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3011  von Willebrand factor, type A  36.45 
 
 
774 aa  51.2  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0179929  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  25.39 
 
 
744 aa  50.8  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  28.77 
 
 
1188 aa  50.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  28.49 
 
 
393 aa  50.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  23.32 
 
 
609 aa  50.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  24.46 
 
 
932 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  27.73 
 
 
775 aa  48.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  28.22 
 
 
335 aa  47.8  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.33 
 
 
673 aa  48.1  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4241  von Willebrand factor, type A  28.45 
 
 
401 aa  47  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33156  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  25.86 
 
 
479 aa  47.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  26.49 
 
 
892 aa  47.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  28.64 
 
 
335 aa  47.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  25.7 
 
 
436 aa  46.6  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  28.07 
 
 
412 aa  46.2  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  26.7 
 
 
1446 aa  46.2  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  30 
 
 
3027 aa  46.6  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2675  von Willebrand factor type A  34.58 
 
 
777 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  31.53 
 
 
418 aa  45.8  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4136  von Willebrand factor type A  31.82 
 
 
461 aa  45.8  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1317  von Willebrand factor type A  32.17 
 
 
1017 aa  45.8  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000794512  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.57 
 
 
680 aa  45.8  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  27.22 
 
 
383 aa  45.4  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  33.64 
 
 
418 aa  45.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  28.99 
 
 
298 aa  45.4  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  26.77 
 
 
332 aa  45.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3008  peptidase M23B  32.06 
 
 
982 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631007  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  26.2 
 
 
427 aa  45.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  27.56 
 
 
319 aa  44.3  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1604  von Willebrand factor type A  30.81 
 
 
1100 aa  44.3  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  23.94 
 
 
317 aa  44.3  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  26.8 
 
 
327 aa  44.3  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>