24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1935 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0801  hypothetical protein  48.55 
 
 		 813 aa  776    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1935  hypothetical protein  100 
 
 		 828 aa  1675    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.115216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2646  hypothetical protein  36.42 
 
 		 877 aa  456  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0657655 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0771  von Willebrand factor, type A  34.41 
 
 		 789 aa  389  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.65454  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1368  von Willebrand factor type A  26.65 
 
 		 788 aa  229  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.483102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  24.11 
 
 		 950 aa  89  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  24.91 
 
 		 828 aa  85.5  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  23.26 
 
 		 914 aa  83.2  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  23.17 
 
 		 847 aa  83.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  24.5 
 
 		 851 aa  82.8  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  23.22 
 
 		 958 aa  79.7  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3926  von Willebrand factor type A  21.86 
 
 		 978 aa  75.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.501815  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  22.85 
 
 		 972 aa  74.7  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  31 
 
 		 951 aa  62  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  25.08 
 
 		 966 aa  61.6  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  21.4 
 
 		 842 aa  60.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  22.28 
 
 		 888 aa  55.5  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  21.39 
 
 		 903 aa  54.7  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  26.95 
 
 		 918 aa  53.5  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1164  von Willebrand factor type A  24.44 
 
 		 859 aa  52.4  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.366027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  21.28 
 
 		 936 aa  51.6  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  27.21 
 
 		 932 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  24.38 
 
 		 902 aa  45.8  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  21.86 
 
 		 717 aa  46.2  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>