175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1716 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  100 
 
 
951 aa  1931    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  38.19 
 
 
918 aa  520  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  36.25 
 
 
958 aa  509  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  34.26 
 
 
966 aa  490  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  35.14 
 
 
950 aa  478  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  34.23 
 
 
972 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3926  von Willebrand factor type A  32.81 
 
 
978 aa  415  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.501815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  34.11 
 
 
932 aa  409  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  33.76 
 
 
936 aa  409  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  34.1 
 
 
828 aa  386  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  28.99 
 
 
902 aa  381  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  31.92 
 
 
914 aa  381  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  34.31 
 
 
903 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  34.93 
 
 
851 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4003  protein of unknown function DUF1355  30.66 
 
 
1023 aa  355  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0902905  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  35.35 
 
 
847 aa  352  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  35.93 
 
 
842 aa  348  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  30.12 
 
 
888 aa  340  5e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1164  von Willebrand factor type A  26.53 
 
 
859 aa  181  7e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.366027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  29.36 
 
 
744 aa  122  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1368  von Willebrand factor type A  24.96 
 
 
788 aa  109  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.483102 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0771  von Willebrand factor, type A  25 
 
 
789 aa  108  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.65454  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  26.41 
 
 
717 aa  106  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  34.48 
 
 
412 aa  94  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  33.7 
 
 
416 aa  92.4  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.04 
 
 
442 aa  87  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0048  von Willebrand factor type A  32.58 
 
 
474 aa  84.7  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.61 
 
 
451 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  32.09 
 
 
418 aa  79.3  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.6 
 
 
460 aa  79.7  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  30.6 
 
 
472 aa  79  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 
421 aa  79  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  31.31 
 
 
462 aa  77.8  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0801  hypothetical protein  22.36 
 
 
813 aa  77.4  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.05 
 
 
472 aa  76.6  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  30.92 
 
 
605 aa  74.7  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  32.57 
 
 
418 aa  73.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  28.7 
 
 
421 aa  71.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  30.85 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  30.85 
 
 
459 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  25.41 
 
 
419 aa  70.1  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  27.81 
 
 
415 aa  70.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1935  hypothetical protein  24.2 
 
 
828 aa  68.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.115216  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  30.35 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  32.38 
 
 
615 aa  68.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  31.77 
 
 
1188 aa  67.8  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  29.05 
 
 
418 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  29.47 
 
 
418 aa  66.6  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  28.91 
 
 
425 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  29.05 
 
 
418 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  29.44 
 
 
419 aa  66.6  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  30.86 
 
 
412 aa  66.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  29.41 
 
 
441 aa  65.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
423 aa  65.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1606  hypothetical protein  27.43 
 
 
691 aa  65.1  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  29.41 
 
 
610 aa  63.9  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  27.18 
 
 
418 aa  63.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  27.32 
 
 
607 aa  63.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  30.29 
 
 
412 aa  63.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  25.99 
 
 
419 aa  62.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  28.44 
 
 
425 aa  62.4  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  26.99 
 
 
701 aa  62  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  32.32 
 
 
750 aa  60.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  30.17 
 
 
490 aa  59.7  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  25.42 
 
 
420 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  33.33 
 
 
753 aa  59.7  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  28.96 
 
 
643 aa  58.5  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  26.6 
 
 
571 aa  58.2  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.68 
 
 
794 aa  58.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  29.67 
 
 
430 aa  57.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.9 
 
 
786 aa  56.6  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  26.87 
 
 
412 aa  57  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.43 
 
 
791 aa  57  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  27.51 
 
 
761 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  26.85 
 
 
625 aa  55.8  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  28.72 
 
 
639 aa  55.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  28.17 
 
 
612 aa  55.5  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1559  hypothetical protein  25 
 
 
691 aa  55.1  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820703  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1507  hypothetical protein  25 
 
 
689 aa  55.1  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306187  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  28.32 
 
 
3027 aa  54.7  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25 
 
 
621 aa  54.7  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  30.39 
 
 
594 aa  54.7  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
543 aa  54.7  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  26.39 
 
 
624 aa  54.7  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  28.25 
 
 
426 aa  54.3  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0004  von Willebrand factor, type A  25.49 
 
 
464 aa  53.9  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2182  hypothetical protein  23.89 
 
 
690 aa  54.3  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.11 
 
 
776 aa  53.9  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  32.48 
 
 
547 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  25.27 
 
 
808 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  28.32 
 
 
546 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  26.44 
 
 
505 aa  53.5  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  26.58 
 
 
755 aa  53.5  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.38 
 
 
755 aa  53.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0397  von Willebrand factor type A  33.06 
 
 
579 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00126629  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  27.78 
 
 
613 aa  52.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  29.03 
 
 
618 aa  52.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2231  hypothetical protein  26.29 
 
 
691 aa  52.8  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  24.34 
 
 
383 aa  52  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3905  hypothetical protein  24.6 
 
 
700 aa  51.6  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20214  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>