51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2182 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2629  hypothetical protein  53.82 
 
 
687 aa  664    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.498144  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3059  protein of unknown function DUF1355  56.67 
 
 
689 aa  778    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3233  hypothetical protein  57.95 
 
 
689 aa  761    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  52 
 
 
696 aa  653    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2795  hypothetical protein  56.81 
 
 
689 aa  773    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79897  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1373  hypothetical protein  53.82 
 
 
687 aa  660    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194254  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  52.23 
 
 
696 aa  646    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  51.85 
 
 
696 aa  650    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2945  hypothetical protein  53.25 
 
 
688 aa  667    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1606  hypothetical protein  64.21 
 
 
691 aa  849    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2278  hypothetical protein  60.43 
 
 
689 aa  756    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1507  hypothetical protein  65.12 
 
 
689 aa  852    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306187  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2268  hypothetical protein  54.83 
 
 
687 aa  686    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.967855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1189  hypothetical protein  53.97 
 
 
687 aa  664    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0912  hypothetical protein  54.91 
 
 
687 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385039  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1292  hypothetical protein  55.62 
 
 
687 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_004310  BR1559  hypothetical protein  65.12 
 
 
691 aa  854    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820703  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3254  hypothetical protein  55.47 
 
 
687 aa  659    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2182  hypothetical protein  100 
 
 
690 aa  1377    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2231  hypothetical protein  50.29 
 
 
691 aa  631  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5168  protein of unknown function DUF1355  51.95 
 
 
692 aa  620  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3475  hypothetical protein  48.2 
 
 
731 aa  615  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.348485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  50.43 
 
 
693 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4483  hypothetical protein  51.59 
 
 
692 aa  611  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2270  protein of unknown function DUF1355  47.84 
 
 
699 aa  610  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1010  hypothetical protein  46.78 
 
 
695 aa  606  9.999999999999999e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2903  hypothetical protein  46.97 
 
 
694 aa  578  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.177101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0686  hypothetical protein  46.7 
 
 
688 aa  568  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503271  normal  0.203205 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0722  hypothetical protein  44.57 
 
 
696 aa  548  1e-154  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440908  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2682  hypothetical protein  45.91 
 
 
687 aa  537  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6144  hypothetical protein  46.18 
 
 
724 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134099  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2770  hypothetical protein  45.1 
 
 
680 aa  524  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0206  hypothetical protein  44.89 
 
 
688 aa  525  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277086  normal  0.243086 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3905  hypothetical protein  42.92 
 
 
700 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20214  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0372  hypothetical protein  42.94 
 
 
690 aa  464  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3010  hypothetical protein  41.97 
 
 
715 aa  426  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2004  hypothetical protein  36.68 
 
 
670 aa  310  4e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  28.44 
 
 
761 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  28.44 
 
 
761 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  28.26 
 
 
761 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  27.32 
 
 
759 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4088  protein of unknown function DUF1355  27.9 
 
 
838 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0545012 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0136  conserved hypothetical protein-putative transmembrane protein  22.87 
 
 
732 aa  68.2  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1416  protein of unknown function DUF1355  22.69 
 
 
829 aa  60.1  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.737911  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1374  hypothetical protein  25.87 
 
 
705 aa  57.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  24.12 
 
 
951 aa  55.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1804  hypothetical protein  26.3 
 
 
878 aa  53.9  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08231  hypothetical protein  21.35 
 
 
677 aa  47.8  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  24.34 
 
 
918 aa  47.8  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  24.32 
 
 
796 aa  47.8  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  23.83 
 
 
842 aa  44.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>