49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0136 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0136  conserved hypothetical protein-putative transmembrane protein  100 
 
 
732 aa  1500    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  26.04 
 
 
796 aa  196  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1416  protein of unknown function DUF1355  23.97 
 
 
829 aa  137  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.737911  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1804  hypothetical protein  22.75 
 
 
878 aa  135  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  26.56 
 
 
761 aa  134  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  26.56 
 
 
761 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  26.39 
 
 
761 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  25.84 
 
 
759 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2313  hypothetical protein  22.6 
 
 
770 aa  102  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.506224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4088  protein of unknown function DUF1355  21.25 
 
 
838 aa  85.5  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0545012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0686  hypothetical protein  24.31 
 
 
688 aa  81.3  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503271  normal  0.203205 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2682  hypothetical protein  24.57 
 
 
687 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6144  hypothetical protein  24.8 
 
 
724 aa  75.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134099  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0206  hypothetical protein  24.8 
 
 
688 aa  73.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277086  normal  0.243086 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0372  hypothetical protein  25.29 
 
 
690 aa  72  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1507  hypothetical protein  24.38 
 
 
689 aa  71.6  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306187  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3059  protein of unknown function DUF1355  23.68 
 
 
689 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1606  hypothetical protein  25.82 
 
 
691 aa  70.5  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  24.29 
 
 
696 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_004310  BR1559  hypothetical protein  24.38 
 
 
691 aa  70.1  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820703  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2795  hypothetical protein  23.45 
 
 
689 aa  69.7  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79897  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3233  hypothetical protein  22.8 
 
 
689 aa  68.9  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2903  hypothetical protein  24.28 
 
 
694 aa  68.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.177101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  23.3 
 
 
696 aa  68.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4483  hypothetical protein  23.06 
 
 
692 aa  67.4  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  23.3 
 
 
696 aa  67.4  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  23.31 
 
 
693 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13684 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0722  hypothetical protein  24.27 
 
 
696 aa  65.9  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440908  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2270  protein of unknown function DUF1355  23.55 
 
 
699 aa  65.1  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5168  protein of unknown function DUF1355  23.76 
 
 
692 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2278  hypothetical protein  22.84 
 
 
689 aa  62.4  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2231  hypothetical protein  23.03 
 
 
691 aa  60.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2770  hypothetical protein  21.5 
 
 
680 aa  59.3  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2182  hypothetical protein  22.87 
 
 
690 aa  59.3  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2945  hypothetical protein  21.6 
 
 
688 aa  56.6  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1292  hypothetical protein  21.36 
 
 
687 aa  54.7  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1010  hypothetical protein  22.06 
 
 
695 aa  53.9  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3905  hypothetical protein  23.35 
 
 
700 aa  53.9  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20214  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1189  hypothetical protein  23.45 
 
 
687 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2268  hypothetical protein  21.96 
 
 
687 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.967855 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2004  hypothetical protein  24.5 
 
 
670 aa  52.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1373  hypothetical protein  21.79 
 
 
687 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194254  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3475  hypothetical protein  26.41 
 
 
731 aa  52  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.348485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0912  hypothetical protein  22 
 
 
687 aa  51.6  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385039  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1340  hypothetical protein  28.77 
 
 
712 aa  50.8  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1374  hypothetical protein  20.46 
 
 
705 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2629  hypothetical protein  21.43 
 
 
687 aa  46.2  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.498144  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3010  hypothetical protein  23.57 
 
 
715 aa  45.8  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3254  hypothetical protein  28.39 
 
 
687 aa  45.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>