23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1340 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1340  hypothetical protein  100 
 
 		 712 aa  1400    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1084  hypothetical protein  24.2 
 
 		 690 aa  225  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0618906  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1374  hypothetical protein  26.15 
 
 		 705 aa  206  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2587  hypothetical protein  25.84 
 
 		 690 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0697  hypothetical protein  22.47 
 
 		 695 aa  167  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08231  hypothetical protein  22.36 
 
 		 677 aa  141  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2888  hypothetical protein  21.58 
 
 		 675 aa  137  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00132631  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4088  protein of unknown function DUF1355  27.29 
 
 		 838 aa  124  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0545012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  26.95 
 
 		 759 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  25.04 
 
 		 761 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  25.46 
 
 		 761 aa  117  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  24.73 
 
 		 761 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  25.08 
 
 		 796 aa  93.2  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1416  protein of unknown function DUF1355  24.25 
 
 		 829 aa  87  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.737911  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0136  conserved hypothetical protein-putative transmembrane protein  22.01 
 
 		 732 aa  70.9  0.00000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1804  hypothetical protein  21.48 
 
 		 878 aa  67.4  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  24.11 
 
 		 696 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  23.85 
 
 		 696 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2313  hypothetical protein  22.08 
 
 		 770 aa  57.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.506224  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0771  von Willebrand factor, type A  24.74 
 
 		 789 aa  56.2  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.65454  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2278  hypothetical protein  26.53 
 
 		 689 aa  48.5  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4483  hypothetical protein  23.54 
 
 		 692 aa  46.6  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  23.47 
 
 		 696 aa  45.4  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>