59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0838 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  100 
 
 		 796 aa  1581    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0136  conserved hypothetical protein-putative transmembrane protein  25.93 
 
 		 732 aa  194  7e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  30.16 
 
 		 761 aa  187  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  29.78 
 
 		 761 aa  184  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  29.66 
 
 		 761 aa  183  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1416  protein of unknown function DUF1355  26.37 
 
 		 829 aa  175  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.737911  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  27.4 
 
 		 759 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1804  hypothetical protein  24.59 
 
 		 878 aa  142  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2313  hypothetical protein  24.04 
 
 		 770 aa  118  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.506224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4088  protein of unknown function DUF1355  25.53 
 
 		 838 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0545012 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3010  hypothetical protein  29.93 
 
 		 715 aa  84.7  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0722  hypothetical protein  26.45 
 
 		 696 aa  82  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1084  hypothetical protein  21.42 
 
 		 690 aa  81.6  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0618906  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3905  hypothetical protein  24.6 
 
 		 700 aa  79.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1340  hypothetical protein  25.13 
 
 		 712 aa  76.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6144  hypothetical protein  25.36 
 
 		 724 aa  72.4  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134099  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2682  hypothetical protein  26.49 
 
 		 687 aa  70.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0697  hypothetical protein  22.49 
 
 		 695 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0206  hypothetical protein  28.46 
 
 		 688 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277086  normal  0.243086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1374  hypothetical protein  21.94 
 
 		 705 aa  65.1  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  24.78 
 
 		 696 aa  65.1  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  25.26 
 
 		 696 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2004  hypothetical protein  28.96 
 
 		 670 aa  60.8  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2278  hypothetical protein  26.1 
 
 		 689 aa  60.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2587  hypothetical protein  20.33 
 
 		 690 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0686  hypothetical protein  23.83 
 
 		 688 aa  60.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503271  normal  0.203205 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08231  hypothetical protein  22.86 
 
 		 677 aa  60.8  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2795  hypothetical protein  25.79 
 
 		 689 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79897  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2903  hypothetical protein  23.82 
 
 		 694 aa  59.7  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.177101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2268  hypothetical protein  26.99 
 
 		 687 aa  59.7  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.967855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3059  protein of unknown function DUF1355  27.55 
 
 		 689 aa  58.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2270  protein of unknown function DUF1355  25.31 
 
 		 699 aa  58.5  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2629  hypothetical protein  28.1 
 
 		 687 aa  57.4  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.498144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0372  hypothetical protein  25.91 
 
 		 690 aa  57  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2770  hypothetical protein  24.55 
 
 		 680 aa  57  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5168  protein of unknown function DUF1355  24.82 
 
 		 692 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3233  hypothetical protein  25.55 
 
 		 689 aa  55.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1606  hypothetical protein  24.32 
 
 		 691 aa  55.5  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4483  hypothetical protein  23.43 
 
 		 692 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  24.88 
 
 		 696 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1010  hypothetical protein  25.4 
 
 		 695 aa  54.7  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1507  hypothetical protein  23.24 
 
 		 689 aa  54.3  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306187  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1559  hypothetical protein  23.24 
 
 		 691 aa  53.9  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820703  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  23.81 
 
 		 903 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2231  hypothetical protein  24.88 
 
 		 691 aa  53.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1373  hypothetical protein  24.72 
 
 		 687 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194254  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  24.13 
 
 		 693 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13684 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3254  hypothetical protein  24.58 
 
 		 687 aa  52  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3475  hypothetical protein  25.81 
 
 		 731 aa  50.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  24.29 
 
 		 932 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1292  hypothetical protein  24.71 
 
 		 687 aa  48.9  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1189  hypothetical protein  25.23 
 
 		 687 aa  47.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0912  hypothetical protein  27.36 
 
 		 687 aa  47.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  25.99 
 
 		 936 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2182  hypothetical protein  24.32 
 
 		 690 aa  46.6  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  23.94 
 
 		 902 aa  46.6  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2945  hypothetical protein  24.9 
 
 		 688 aa  46.6  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2888  hypothetical protein  20.47 
 
 		 675 aa  44.3  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00132631  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  28.65 
 
 		 315 aa  44.3  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>