47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2004 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2004  hypothetical protein  100 
 
 		 670 aa  1282    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3010  hypothetical protein  41.41 
 
 		 715 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2231  hypothetical protein  36.75 
 
 		 691 aa  371  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  37.54 
 
 		 696 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2268  hypothetical protein  36.92 
 
 		 687 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.967855 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  37.3 
 
 		 696 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1189  hypothetical protein  38.56 
 
 		 687 aa  357  5e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2945  hypothetical protein  38.35 
 
 		 688 aa  351  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1292  hypothetical protein  37.86 
 
 		 687 aa  347  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0722  hypothetical protein  36.97 
 
 		 696 aa  345  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2270  protein of unknown function DUF1355  37.08 
 
 		 699 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0372  hypothetical protein  39.56 
 
 		 690 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2278  hypothetical protein  37.8 
 
 		 689 aa  344  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1373  hypothetical protein  35.97 
 
 		 687 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194254  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  36.67 
 
 		 696 aa  343  8e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1507  hypothetical protein  37.62 
 
 		 689 aa  340  5e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306187  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2795  hypothetical protein  34.39 
 
 		 689 aa  339  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79897  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_004310  BR1559  hypothetical protein  37.5 
 
 		 691 aa  339  9e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820703  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1010  hypothetical protein  35.09 
 
 		 695 aa  339  9.999999999999999e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5168  protein of unknown function DUF1355  39.07 
 
 		 692 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0912  hypothetical protein  36.23 
 
 		 687 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2903  hypothetical protein  36.82 
 
 		 694 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.177101 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3254  hypothetical protein  36.91 
 
 		 687 aa  337  5.999999999999999e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1606  hypothetical protein  37.84 
 
 		 691 aa  336  7e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3059  protein of unknown function DUF1355  34.54 
 
 		 689 aa  335  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3475  hypothetical protein  37.21 
 
 		 731 aa  334  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2629  hypothetical protein  36.61 
 
 		 687 aa  330  7e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.498144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  37.42 
 
 		 693 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4483  hypothetical protein  37.46 
 
 		 692 aa  325  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0686  hypothetical protein  35.33 
 
 		 688 aa  322  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503271  normal  0.203205 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2182  hypothetical protein  36.88 
 
 		 690 aa  319  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3233  hypothetical protein  34.48 
 
 		 689 aa  317  6e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0206  hypothetical protein  37.48 
 
 		 688 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277086  normal  0.243086 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2682  hypothetical protein  36.41 
 
 		 687 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2770  hypothetical protein  36.12 
 
 		 680 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6144  hypothetical protein  36.87 
 
 		 724 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134099  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3905  hypothetical protein  37.64 
 
 		 700 aa  297  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  32.43 
 
 		 761 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  32.43 
 
 		 761 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  32.43 
 
 		 761 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  29.98 
 
 		 759 aa  134  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4088  protein of unknown function DUF1355  28.09 
 
 		 838 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0545012 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0136  conserved hypothetical protein-putative transmembrane protein  24 
 
 		 732 aa  61.2  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  28.96 
 
 		 796 aa  60.8  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1374  hypothetical protein  25.45 
 
 		 705 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1416  protein of unknown function DUF1355  23.54 
 
 		 829 aa  50.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.737911  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2587  hypothetical protein  21.72 
 
 		 690 aa  45.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>