49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1373 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4483  hypothetical protein  54.72 
 
 		 692 aa  679    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2268  hypothetical protein  83.11 
 
 		 687 aa  1143    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.967855 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1507  hypothetical protein  51.96 
 
 		 689 aa  655    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306187  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2278  hypothetical protein  54.06 
 
 		 689 aa  649    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1606  hypothetical protein  51.23 
 
 		 691 aa  650    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2231  hypothetical protein  50.36 
 
 		 691 aa  640    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2945  hypothetical protein  62.7 
 
 		 688 aa  838    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  53.2 
 
 		 696 aa  679    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  52.69 
 
 		 693 aa  662    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13684 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2629  hypothetical protein  80.93 
 
 		 687 aa  1087    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.498144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3475  hypothetical protein  48.96 
 
 		 731 aa  656    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  52.84 
 
 		 696 aa  664    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1373  hypothetical protein  100 
 
 		 687 aa  1372    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194254  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2795  hypothetical protein  48.98 
 
 		 689 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79897  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2270  protein of unknown function DUF1355  53.48 
 
 		 699 aa  708    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  52.69 
 
 		 696 aa  680    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5168  protein of unknown function DUF1355  55.38 
 
 		 692 aa  694    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3059  protein of unknown function DUF1355  48.32 
 
 		 689 aa  641    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1189  hypothetical protein  89.23 
 
 		 687 aa  1179    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_004310  BR1559  hypothetical protein  51.96 
 
 		 691 aa  658    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820703  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0912  hypothetical protein  85.01 
 
 		 687 aa  1121    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2182  hypothetical protein  54.3 
 
 		 690 aa  648    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3254  hypothetical protein  83.26 
 
 		 687 aa  1085    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1292  hypothetical protein  89.96 
 
 		 687 aa  1179    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3233  hypothetical protein  50.08 
 
 		 689 aa  629  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2903  hypothetical protein  45.66 
 
 		 694 aa  556  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.177101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0686  hypothetical protein  45 
 
 		 688 aa  555  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503271  normal  0.203205 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2682  hypothetical protein  46.39 
 
 		 687 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0206  hypothetical protein  44.98 
 
 		 688 aa  532  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277086  normal  0.243086 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6144  hypothetical protein  47.2 
 
 		 724 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134099  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0722  hypothetical protein  42.4 
 
 		 696 aa  532  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2770  hypothetical protein  43.45 
 
 		 680 aa  514  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1010  hypothetical protein  40.57 
 
 		 695 aa  509  1e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0372  hypothetical protein  44.6 
 
 		 690 aa  501  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3905  hypothetical protein  43.19 
 
 		 700 aa  467  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3010  hypothetical protein  41.21 
 
 		 715 aa  458  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2004  hypothetical protein  35.82 
 
 		 670 aa  329  9e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  29.8 
 
 		 761 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  29.8 
 
 		 761 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  29.6 
 
 		 761 aa  162  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  29.52 
 
 		 759 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4088  protein of unknown function DUF1355  26.73 
 
 		 838 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0545012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1374  hypothetical protein  26.34 
 
 		 705 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1416  protein of unknown function DUF1355  23.02 
 
 		 829 aa  54.3  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.737911  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0136  conserved hypothetical protein-putative transmembrane protein  20.83 
 
 		 732 aa  53.5  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  24.72 
 
 		 796 aa  53.5  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1804  hypothetical protein  25.62 
 
 		 878 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08231  hypothetical protein  21.54 
 
 		 677 aa  49.3  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2587  hypothetical protein  23.08 
 
 		 690 aa  45.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>