54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1456 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2629  hypothetical protein  52.03 
 
 		 687 aa  656    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.498144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5168  protein of unknown function DUF1355  77.99 
 
 		 692 aa  1038    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  99.43 
 
 		 696 aa  1361    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2270  protein of unknown function DUF1355  57.02 
 
 		 699 aa  724    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1373  hypothetical protein  52.61 
 
 		 687 aa  659    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194254  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  96.12 
 
 		 696 aa  1267    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3475  hypothetical protein  53.59 
 
 		 731 aa  699    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4483  hypothetical protein  76.69 
 
 		 692 aa  1012    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  83.91 
 
 		 693 aa  1110    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  100 
 
 		 696 aa  1367    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2945  hypothetical protein  53.76 
 
 		 688 aa  673    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2268  hypothetical protein  53.18 
 
 		 687 aa  669    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.967855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1189  hypothetical protein  53.33 
 
 		 687 aa  677    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0912  hypothetical protein  52.32 
 
 		 687 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1292  hypothetical protein  53.04 
 
 		 687 aa  672    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3254  hypothetical protein  54.45 
 
 		 687 aa  667    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2795  hypothetical protein  50.36 
 
 		 689 aa  634  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79897  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3059  protein of unknown function DUF1355  49.78 
 
 		 689 aa  628  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2182  hypothetical protein  51.01 
 
 		 690 aa  627  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1559  hypothetical protein  49.28 
 
 		 691 aa  622  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820703  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1507  hypothetical protein  49.28 
 
 		 689 aa  619  1e-176  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306187  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1606  hypothetical protein  48.85 
 
 		 691 aa  617  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2231  hypothetical protein  50.72 
 
 		 691 aa  607  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2278  hypothetical protein  48.49 
 
 		 689 aa  586  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3233  hypothetical protein  47.41 
 
 		 689 aa  578  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2903  hypothetical protein  45.51 
 
 		 694 aa  538  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.177101 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2770  hypothetical protein  46.83 
 
 		 680 aa  533  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1010  hypothetical protein  44.08 
 
 		 695 aa  532  1e-150  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0206  hypothetical protein  45.25 
 
 		 688 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277086  normal  0.243086 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2682  hypothetical protein  45.27 
 
 		 687 aa  515  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0686  hypothetical protein  44.52 
 
 		 688 aa  512  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503271  normal  0.203205 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6144  hypothetical protein  46.36 
 
 		 724 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134099  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0722  hypothetical protein  42.2 
 
 		 696 aa  507  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3905  hypothetical protein  45.57 
 
 		 700 aa  482  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3010  hypothetical protein  44.02 
 
 		 715 aa  464  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0372  hypothetical protein  42.81 
 
 		 690 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2004  hypothetical protein  37.88 
 
 		 670 aa  316  8e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  30.9 
 
 		 761 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  30.9 
 
 		 761 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  32.08 
 
 		 761 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  29.47 
 
 		 759 aa  142  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4088  protein of unknown function DUF1355  26.82 
 
 		 838 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0545012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1374  hypothetical protein  26.64 
 
 		 705 aa  85.5  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0136  conserved hypothetical protein-putative transmembrane protein  23.3 
 
 		 732 aa  68.2  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1416  protein of unknown function DUF1355  23.54 
 
 		 829 aa  68.2  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.737911  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1084  hypothetical protein  22.98 
 
 		 690 aa  60.1  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0618906  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  25.89 
 
 		 796 aa  59.7  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2587  hypothetical protein  23.89 
 
 		 690 aa  54.7  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1478  hypothetical protein  30.95 
 
 		 245 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.147356 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1790  hypothetical protein  32.64 
 
 		 245 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1494  hypothetical protein  32.64 
 
 		 245 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.596585  hitchhiker  0.00000000000000749394 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1961  hypothetical protein  32.64 
 
 		 245 aa  48.5  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000998327 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1515  hypothetical protein  32.64 
 
 		 245 aa  48.5  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.702352  hitchhiker  0.0000000353352 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1804  hypothetical protein  25.71 
 
 		 878 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>