26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1084 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1084  hypothetical protein  100 
 
 		 690 aa  1420    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0618906  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1374  hypothetical protein  37.71 
 
 		 705 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2587  hypothetical protein  37.08 
 
 		 690 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0697  hypothetical protein  29.65 
 
 		 695 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1340  hypothetical protein  23.8 
 
 		 712 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2888  hypothetical protein  27.27 
 
 		 675 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00132631  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08231  hypothetical protein  25.36 
 
 		 677 aa  178  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  21.42 
 
 		 796 aa  75.1  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  25.4 
 
 		 759 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  24.87 
 
 		 761 aa  63.9  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  24.87 
 
 		 761 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  24.34 
 
 		 761 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  22.98 
 
 		 696 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1804  hypothetical protein  21.35 
 
 		 878 aa  60.5  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  22.98 
 
 		 696 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4088  protein of unknown function DUF1355  21.66 
 
 		 838 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0545012 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2629  hypothetical protein  24.73 
 
 		 687 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.498144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0686  hypothetical protein  23.17 
 
 		 688 aa  53.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503271  normal  0.203205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1292  hypothetical protein  23.73 
 
 		 687 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3475  hypothetical protein  23.44 
 
 		 731 aa  51.2  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  22.98 
 
 		 696 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  23.46 
 
 		 693 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13684 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3254  hypothetical protein  23.6 
 
 		 687 aa  48.5  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2770  hypothetical protein  22.55 
 
 		 680 aa  44.7  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4483  hypothetical protein  21.23 
 
 		 692 aa  44.3  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2231  hypothetical protein  23.55 
 
 		 691 aa  44.7  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>