49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3638 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2629  hypothetical protein  52.53 
 
 
687 aa  665    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.498144  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2268  hypothetical protein  53.84 
 
 
687 aa  676    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.967855 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2945  hypothetical protein  55.01 
 
 
688 aa  683    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  83.91 
 
 
696 aa  1135    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  100 
 
 
693 aa  1361    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4483  hypothetical protein  80.66 
 
 
692 aa  1043    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3475  hypothetical protein  53.73 
 
 
731 aa  701    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.348485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  84.77 
 
 
696 aa  1129    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1373  hypothetical protein  52.69 
 
 
687 aa  659    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194254  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3254  hypothetical protein  55.49 
 
 
687 aa  680    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1292  hypothetical protein  53.13 
 
 
687 aa  675    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0912  hypothetical protein  52.39 
 
 
687 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385039  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2270  protein of unknown function DUF1355  56.47 
 
 
699 aa  716    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1189  hypothetical protein  53.13 
 
 
687 aa  676    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  84.05 
 
 
696 aa  1136    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5168  protein of unknown function DUF1355  79.94 
 
 
692 aa  1047    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2795  hypothetical protein  50.58 
 
 
689 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79897  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3059  protein of unknown function DUF1355  50.29 
 
 
689 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_004310  BR1559  hypothetical protein  47.98 
 
 
691 aa  607  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820703  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1606  hypothetical protein  48.13 
 
 
691 aa  607  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1507  hypothetical protein  47.98 
 
 
689 aa  605  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306187  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2182  hypothetical protein  50.43 
 
 
690 aa  608  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2231  hypothetical protein  49.42 
 
 
691 aa  600  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2278  hypothetical protein  48.27 
 
 
689 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3233  hypothetical protein  46.03 
 
 
689 aa  555  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2903  hypothetical protein  46.26 
 
 
694 aa  543  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.177101 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1010  hypothetical protein  42.65 
 
 
695 aa  535  1e-150  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2770  hypothetical protein  45.9 
 
 
680 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0686  hypothetical protein  45.61 
 
 
688 aa  512  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503271  normal  0.203205 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0206  hypothetical protein  44.35 
 
 
688 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277086  normal  0.243086 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0722  hypothetical protein  41.36 
 
 
696 aa  496  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440908  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2682  hypothetical protein  44.79 
 
 
687 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6144  hypothetical protein  45.06 
 
 
724 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134099  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3905  hypothetical protein  44.32 
 
 
700 aa  480  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20214  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0372  hypothetical protein  42.37 
 
 
690 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3010  hypothetical protein  42.67 
 
 
715 aa  442  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2004  hypothetical protein  37.9 
 
 
670 aa  299  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  30.81 
 
 
761 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  30.81 
 
 
761 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  31.57 
 
 
761 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  29.54 
 
 
759 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4088  protein of unknown function DUF1355  26.09 
 
 
838 aa  118  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0545012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1374  hypothetical protein  29.79 
 
 
705 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0136  conserved hypothetical protein-putative transmembrane protein  23.26 
 
 
732 aa  74.7  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1416  protein of unknown function DUF1355  23.2 
 
 
829 aa  67.8  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.737911  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2587  hypothetical protein  24.38 
 
 
690 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.293714  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  24.07 
 
 
796 aa  55.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1084  hypothetical protein  22.22 
 
 
690 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0618906  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1804  hypothetical protein  26.79 
 
 
878 aa  53.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>