50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2795 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2795  hypothetical protein  100 
 
 
689 aa  1387    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79897  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1606  hypothetical protein  59.04 
 
 
691 aa  792    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2278  hypothetical protein  69.38 
 
 
689 aa  948    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_004310  BR1559  hypothetical protein  59.19 
 
 
691 aa  798    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820703  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1507  hypothetical protein  59.04 
 
 
689 aa  798    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306187  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2268  hypothetical protein  49.78 
 
 
687 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.967855 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2945  hypothetical protein  51.31 
 
 
688 aa  639    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2182  hypothetical protein  56.52 
 
 
690 aa  728    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3233  hypothetical protein  70.43 
 
 
689 aa  957    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3059  protein of unknown function DUF1355  96.81 
 
 
689 aa  1328    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  50.81 
 
 
696 aa  633  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  50.81 
 
 
696 aa  632  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1373  hypothetical protein  49.39 
 
 
687 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194254  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  50.67 
 
 
696 aa  625  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1292  hypothetical protein  49.54 
 
 
687 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0912  hypothetical protein  49.64 
 
 
687 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385039  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1189  hypothetical protein  48.32 
 
 
687 aa  618  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2270  protein of unknown function DUF1355  48.34 
 
 
699 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3475  hypothetical protein  47.59 
 
 
731 aa  613  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.348485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2629  hypothetical protein  49.49 
 
 
687 aa  614  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.498144  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  50.58 
 
 
693 aa  611  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13684 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3254  hypothetical protein  51.1 
 
 
687 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5168  protein of unknown function DUF1355  49.42 
 
 
692 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2231  hypothetical protein  47.61 
 
 
691 aa  585  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1010  hypothetical protein  44.28 
 
 
695 aa  586  1e-166  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4483  hypothetical protein  48.7 
 
 
692 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2903  hypothetical protein  44.68 
 
 
694 aa  548  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.177101 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6144  hypothetical protein  49.04 
 
 
724 aa  545  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134099  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2682  hypothetical protein  48.87 
 
 
687 aa  542  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0206  hypothetical protein  48.23 
 
 
688 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277086  normal  0.243086 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0686  hypothetical protein  46.35 
 
 
688 aa  522  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503271  normal  0.203205 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0722  hypothetical protein  41.22 
 
 
696 aa  520  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440908  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2770  hypothetical protein  46.91 
 
 
680 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3905  hypothetical protein  43.14 
 
 
700 aa  466  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20214  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0372  hypothetical protein  41.48 
 
 
690 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3010  hypothetical protein  39.97 
 
 
715 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2004  hypothetical protein  34.01 
 
 
670 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  31.01 
 
 
761 aa  154  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  31.03 
 
 
761 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  30.77 
 
 
761 aa  150  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  27.99 
 
 
759 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4088  protein of unknown function DUF1355  30.07 
 
 
838 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0545012 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0136  conserved hypothetical protein-putative transmembrane protein  23.45 
 
 
732 aa  69.7  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1416  protein of unknown function DUF1355  24.07 
 
 
829 aa  60.8  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.737911  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  25.79 
 
 
796 aa  59.7  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1374  hypothetical protein  29.89 
 
 
705 aa  51.2  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  23.28 
 
 
918 aa  47.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  24.23 
 
 
932 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2587  hypothetical protein  22.71 
 
 
690 aa  44.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.293714  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1084  hypothetical protein  21.52 
 
 
690 aa  44.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0618906  normal  0.145562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>