47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2945 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3475  hypothetical protein  53.39 
 
 
731 aa  694    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.348485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2268  hypothetical protein  63.19 
 
 
687 aa  845    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.967855 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1507  hypothetical protein  51.74 
 
 
689 aa  657    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306187  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1606  hypothetical protein  51.38 
 
 
691 aa  652    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2231  hypothetical protein  51.15 
 
 
691 aa  644    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2945  hypothetical protein  100 
 
 
688 aa  1356    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  54.02 
 
 
696 aa  686    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  55.01 
 
 
693 aa  676    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4483  hypothetical protein  56.88 
 
 
692 aa  677    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2629  hypothetical protein  63.77 
 
 
687 aa  823    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.498144  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  54.84 
 
 
696 aa  681    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1373  hypothetical protein  62.7 
 
 
687 aa  835    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194254  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2795  hypothetical protein  51.31 
 
 
689 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79897  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2270  protein of unknown function DUF1355  57.23 
 
 
699 aa  726    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  53.87 
 
 
696 aa  682    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5168  protein of unknown function DUF1355  56.17 
 
 
692 aa  699    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3233  hypothetical protein  50.29 
 
 
689 aa  635    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3059  protein of unknown function DUF1355  51.17 
 
 
689 aa  657    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_004310  BR1559  hypothetical protein  51.59 
 
 
691 aa  658    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820703  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1189  hypothetical protein  63.77 
 
 
687 aa  838    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2182  hypothetical protein  53.25 
 
 
690 aa  651    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3254  hypothetical protein  64.3 
 
 
687 aa  821    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0912  hypothetical protein  63.57 
 
 
687 aa  826    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385039  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1292  hypothetical protein  63.28 
 
 
687 aa  842    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2278  hypothetical protein  51.53 
 
 
689 aa  621  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2903  hypothetical protein  47.42 
 
 
694 aa  587  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.177101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0686  hypothetical protein  45.78 
 
 
688 aa  542  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503271  normal  0.203205 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0722  hypothetical protein  43.81 
 
 
696 aa  530  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440908  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2770  hypothetical protein  45.16 
 
 
680 aa  523  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2682  hypothetical protein  45.32 
 
 
687 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6144  hypothetical protein  46.96 
 
 
724 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134099  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0206  hypothetical protein  45.11 
 
 
688 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277086  normal  0.243086 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0372  hypothetical protein  44.16 
 
 
690 aa  502  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1010  hypothetical protein  39.42 
 
 
695 aa  495  9.999999999999999e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3010  hypothetical protein  44.07 
 
 
715 aa  467  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3905  hypothetical protein  43.44 
 
 
700 aa  466  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20214  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2004  hypothetical protein  37.7 
 
 
670 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  31.77 
 
 
761 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  31.77 
 
 
761 aa  157  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  31.77 
 
 
761 aa  157  8e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  31.55 
 
 
759 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4088  protein of unknown function DUF1355  27.59 
 
 
838 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0545012 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08231  hypothetical protein  21.59 
 
 
677 aa  57.4  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0136  conserved hypothetical protein-putative transmembrane protein  21.6 
 
 
732 aa  57  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1416  protein of unknown function DUF1355  24.37 
 
 
829 aa  55.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.737911  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1374  hypothetical protein  28.23 
 
 
705 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  24.9 
 
 
796 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>