50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1292 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4483  hypothetical protein  54.57 
 
 		 692 aa  682    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2268  hypothetical protein  82.53 
 
 		 687 aa  1133    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.967855 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1507  hypothetical protein  52.25 
 
 		 689 aa  658    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306187  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2278  hypothetical protein  53.91 
 
 		 689 aa  653    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1606  hypothetical protein  51.88 
 
 		 691 aa  649    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2231  hypothetical protein  50.79 
 
 		 691 aa  653    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2945  hypothetical protein  63.28 
 
 		 688 aa  847    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  53.65 
 
 		 696 aa  689    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  53.13 
 
 		 693 aa  675    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13684 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2629  hypothetical protein  82.24 
 
 		 687 aa  1100    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.498144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3475  hypothetical protein  50.49 
 
 		 731 aa  674    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  53.86 
 
 		 696 aa  679    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1373  hypothetical protein  89.96 
 
 		 687 aa  1177    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194254  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2795  hypothetical protein  49.42 
 
 		 689 aa  642    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79897  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2270  protein of unknown function DUF1355  54.43 
 
 		 699 aa  720    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  53.41 
 
 		 696 aa  691    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5168  protein of unknown function DUF1355  56.89 
 
 		 692 aa  710    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3059  protein of unknown function DUF1355  48.32 
 
 		 689 aa  636    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1189  hypothetical protein  92.58 
 
 		 687 aa  1211    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_004310  BR1559  hypothetical protein  52.25 
 
 		 691 aa  661    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820703  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2182  hypothetical protein  55.31 
 
 		 690 aa  652    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0912  hypothetical protein  85.88 
 
 		 687 aa  1134    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3254  hypothetical protein  83.55 
 
 		 687 aa  1084    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1292  hypothetical protein  100 
 
 		 687 aa  1376    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3233  hypothetical protein  50.38 
 
 		 689 aa  630  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2903  hypothetical protein  46.04 
 
 		 694 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.177101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0686  hypothetical protein  45.57 
 
 		 688 aa  557  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503271  normal  0.203205 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2682  hypothetical protein  46 
 
 		 687 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0206  hypothetical protein  45.43 
 
 		 688 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277086  normal  0.243086 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0722  hypothetical protein  42.54 
 
 		 696 aa  533  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6144  hypothetical protein  47.28 
 
 		 724 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134099  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2770  hypothetical protein  43.99 
 
 		 680 aa  512  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1010  hypothetical protein  41.09 
 
 		 695 aa  510  1e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0372  hypothetical protein  44.17 
 
 		 690 aa  499  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3010  hypothetical protein  42.5 
 
 		 715 aa  472  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3905  hypothetical protein  43.08 
 
 		 700 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2004  hypothetical protein  36.87 
 
 		 670 aa  334  3e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  29.6 
 
 		 761 aa  157  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  29.53 
 
 		 761 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  29.53 
 
 		 761 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  29.52 
 
 		 759 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4088  protein of unknown function DUF1355  27.19 
 
 		 838 aa  124  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0545012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1374  hypothetical protein  25.43 
 
 		 705 aa  61.6  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0136  conserved hypothetical protein-putative transmembrane protein  20.88 
 
 		 732 aa  60.1  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1416  protein of unknown function DUF1355  23.21 
 
 		 829 aa  55.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.737911  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08231  hypothetical protein  21.9 
 
 		 677 aa  54.3  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1084  hypothetical protein  23.73 
 
 		 690 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0618906  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2587  hypothetical protein  21.76 
 
 		 690 aa  50.8  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  24.71 
 
 		 796 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1804  hypothetical protein  24.04 
 
 		 878 aa  45.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>